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Enregistrement W2939396942 · doi:10.1094/pbiomes-03-19-0014-r

A Biosensor-Based Assay (<i>GlnLux</i>-Agar) Shows Defoliation Triggers Rapid Release of Glutamine from Nodules and Young Roots of Forage Legumes

2019· article· en· W2939396942 sur OpenAlexafffund
Malinda S. Thilakarathna, Manish N. Raizada

Notice bibliographique

RevuePhytobiomes Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesGlobal Affairs CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaInternational Development Research CentreClemson University
Mots-clésRhizosphereRed CloverBiologyLegumeForageNitrogen fixationTrifolium repensExudateRoot noduleAgronomyMedicago sativaBotanyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Forage legumes experience defoliation from grazing and injury in both natural and agricultural ecosystems. Defoliation induces rhizodeposition of nitrogen (N) compounds from root systems that can feed microbes and plants that depend on the rhizosphere. The literature suggests that N exudates are primarily released from root tips, and those from legume nodules are released via slow nodule decomposition. However, the early timing and precise locations of N release postdefoliation are poorly characterized. The objectives of this study were to directly image tissue-specific N exudation sites in forage legumes, specifically for glutamine, and to do so at early time points postdefoliation. Glutamine is the primary assimilate of symbiotic nitrogen fixation in nodules and a key transport form of fixed N in amide-exporting legumes. Three amide-exporting forages, alfalfa (Medicago sativa), red clover (Trifolium pretense), and white clover (Trifolium repens), were defoliated or not, and placed on agar embedded with whole cell biosensor cells (GlnLux) that detect glutamine. There were two unexpected findings. First, Gln release occurred rapidly, starting within 2 h postdefoliation, depleting rapidly. Second, the sources of early Gln release were primarily nodules in addition to the expected young lateral roots/root tips. Lux quantification statistically confirmed the key findings. These observations suggest that N exudate release should be added to the list of defoliation stress early responses in nodules, and may have implications for our understanding of how defoliation impacts the rhizosphere microbiome. Furthermore, GlnLux-agar imaging represents a new assay to explore the proposed but yet unknown mechanisms underlying organic N exudation in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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