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Enregistrement W2939753315 · doi:10.5812/jjm.14463

FLASH-PCR as a Simple and Efficient Method for Detection of Brucella spp. Infection

2019· article· en· W2939753315 sur OpenAlexfundno aff
Alireza Moradabadi, Azam Ahmadi, Manijeh Kahbazi, Hossein Sarmadian, Mohammad Arjomandzadegan

Notice bibliographique

RevueJundishapur Journal of Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueBrucella: diagnosis, epidemiology, treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesArak University of Medical SciencesInternational Development Research Centre
Mots-clésBrucellaBrucella melitensisBrucellosisPolymerase chain reactionMicrobiologyAntigenVirologyBiologyMedicineGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Brucella spp. are Gram-positive, rod-shaped, and spore-forming bacilli. Brucella abortus and B. melitensis are the main causes of brucellosis. Objectives: The aim of the study was to establish a rapid and simple molecular method for the detection of this disease. Methods: Forty-five Brucella spp. were isolated from blood samples using the BACTEC Fluorescent 9050 system and were detected by anti-IgM or IgG Brucella specific antigen. DNA extraction was conducted on all samples. Fluorescent amplification based specific hybridization (FLASH-PCR) test was utilized to detect the 351-bp fragment from eryD gene, which was specific for Brucella spp. Results: A 351-bp fragment resulted from PCR reaction and showed the accuracy of designed primers. This fragment was successfully amplified in the FLASH-PCR reaction. In this study, we have positive and negative samples and a standard method. In addition, we calculated the sensitivity and specificity of this method as 100%. Conclusions: Results of the study was proved that the FLASH-PCR method was a rapid, sensitive, and safe method for the detection of Brucella genome in whole blood samples of patient harbored brucellosis and is recommended for routine usage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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