MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2939906019 · doi:10.1002/tax.12026

Cryptic species in an ancient flowering‐plant lineage (Hydatellaceae, Nymphaeales) revealed by molecular and micromorphological data

2019· article· en· W2939906019 sur OpenAlexafffund
Dmitry D. Sokoloff, Isabel Marques, Terry Desmond Macfarlane, Margarita V. Remizowa, Vivienne K. Y. Lam, Jaume Pellicer, Oriane Hidalgo, Paula J. Rudall, Sean W. Graham

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Species Descriptions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLomonosov Moscow State UniversityRussian Foundation for Basic ResearchEuropean Commission
Mots-clésBiologyEndemismLineage (genetic)HerbariumGenusEcologySpecies complexAllopatric speciationRange (aeronautics)BiodiversityPhylogenetic treeZoologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The flora of the southwestern Australian biodiversity hotspot is rich in endemic species, many of which remain to be discovered or properly described; estimates of species diversity and levels of endemism should take into account the possible occurrence of cryptic species. Here we explore taxonomic diversity in a Western Australian lineage belonging to the primarily Australian genus Trithuria, the sole genus of Hydatellaceae (Nymphaeales). Recent molecular evidence supports the existence of cryptic species in self‐pollinating members of section Trithuria . We investigate Western Australian plants currently classified as T. australis s.l., a self‐pollinating member of the section Hydatella . Using evidence from microsatellite data (SSRs), an expanded molecular phylogenetic analysis based on four plastid markers, and fruit micromorphology, we suggest that material traditionally classified as T. australis s.l. belongs to at least four species. Two species occur in the northern part of the distribution range of the group (31° S to 33°27′ S), and two in the southern part (33°27′ S to 35° S). Each northern species has distinctive fruit micromorphology not recorded in other members of the genus. The two southern species are well characterized by molecular characters and seem to be allopatric, but lack obvious morphological differences from each other. We describe one of the northern species as T. fitzgeraldii sp. nov. However, clarifying the names of the other three species is currently problematic as T. australis and another available name are based on collections made 117 years ago, from localities distant from any subsequent records of Hydatellaceae. Based on genome size estimations, we also demonstrate two ploidy levels in the T. australis complex. Our study supports the view that species diversity in Hydatellaceae is strongly underestimated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTaxonMême sujetPlant and Fungal Species DescriptionsTravaux en français237 207