Reduced diversity of AM fungi in annually cropped fields of the Canadian prairie
Notice bibliographique
Résumé
The arbuscular mycorrhizal (AM) fungi are important service providers to agriculture that are impacted by certain cultural practices. We assessed the status of AM fungal resources in the Prairie, from the Grey to the Brown soil zone, through sampling 176 wheat fields, 117 adjacent roadsides and 24 natural areas, at heading. The 18S rRNA gene sequences of AM fungi in soil metagenomic DNA accounted for 15% of all fungal target sequences recorded, and clustered in 122 operational taxonomic units (OTUs), a proxy for species. A few OTUs dominated under each land use type, and these OTUs often dominated under all three types of land use. The AM fungal community was influenced by land use and soil type. The size of the family Claroideoglomeraceae decreased from Black to Brown soils, and from roadside to field soil. On average, about eight OTUs were found in a field or a natural soil as compared to 14 in roadsides, and diversity (Shannon index) was lowest in cropland where the community was very uneven. The diversity and abundance of AM fungi was low in Brown soils. Lower AM fungal abundance and diversity in 2009, the dry year, than in 2010, the wet year, suggests that the proliferation of AM fungi in Brown soils may be limited by water availability. A long history of frequent fallow and wheat monoculture in the Brown soil zone may also explain reduced AM fungal diversity in these dry soils.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».