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Enregistrement W2940363702 · doi:10.1186/s13059-018-1608-9

Circadian oscillations of cytosine modification in humans contribute to epigenetic variability, aging, and complex disease

2019· article· en· W2940363702 sur OpenAlexafffund
Gabriel Oh, Karolis Koncevičius, Sasha B. Ebrahimi, Matthew Carlucci, Daniel E. Groot, Akhil Nair, Aiping Zhang, Algimantas Kriščiūnas, Edward Oh, Viviane Labrie, Albert H.C. Wong, Juozas Gordevičius, Peixin Jia, Miki Susic, Artūras Petronis

Notice bibliographique

RevueGenome biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthCanadian Institutes of Health ResearchLietuvos Mokslo TarybaFondation Brain CanadaCentre for Addiction and Mental Health FoundationAlzheimer's SocietyBrain and Behavior Research FoundationKrembil FoundationScottish Rite Charitable Foundation of CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésEpigenomeBiologyCircadian rhythmEpigeneticsDNA methylationEpigenesisGeneticsDiseaseMechanism (biology)NeuroscienceGeneInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Maintenance of physiological circadian rhythm plays a crucial role in human health. Numerous studies have shown that disruption of circadian rhythm may increase risk for malignant, psychiatric, metabolic, and other diseases. RESULTS: Extending our recent findings of oscillating cytosine modifications (osc-modCs) in mice, in this study, we show that osc-modCs are also prevalent in human neutrophils. Osc-modCs may play a role in gene regulation, can explain parts of intra- and inter-individual epigenetic variation, and are signatures of aging. Finally, we show that osc-modCs are linked to three complex diseases and provide a new interpretation of cross-sectional epigenome-wide association studies. CONCLUSIONS: Our findings suggest that loss of balance between cytosine methylation and demethylation during the circadian cycle can be a potential mechanism for complex disease. Additional experiments, however, are required to investigate the possible involvement of confounding effects, such as hidden cellular heterogeneity. Circadian rhythmicity, one of the key adaptations of life forms on Earth, may contribute to frailty later in life.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,705
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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