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Enregistrement W2940897955 · doi:10.1093/neuonc/noz036.200

MEDU-42. ELUCIDATING THE ROLE OF STRESS GRANULE FORMATION IN MEDULLOBLASTOMA

2019· article· en· W2940897955 sur OpenAlexaff
Sofya Langman, Michael M. Lizardo, Antoine Forget, Olivier Ayrault, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaStress granuleCancer researchApoptosisVincristineMalignancyKinaseCell growthIntegrated stress responseBiologyTranslation (biology)MedicineCell biologyInternal medicineGeneChemotherapyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB) is the most common pediatric brain malignancy, accounting for 20% of diagnosed brain tumors in children. The Group 3 (G3) MB subtype is found to be especially malignant and is commonly associated with MYC over-expression. Current G3 MB treatment regimens provide for 50% 5-year survival rates and are associated with severe side effects, including hearing loss and neurocognitive deficits. High expression of stress granule (SG) proteins such as G3BP1 and PAPBPC1 correlates with poor survival outcome in G3 MB patients. We propose that formation of SGs, mRNP granules assembled under cellular stress, is integral for MB tumor progression, and suggest that inhibition of SG formation is a novel therapeutic strategy. In order to identify key proteins for SG formation we set up a siRNA screen for 95 genes that have previously been linked to SG formation, and that are highly expressed in MB G3 tumors. The screen has been done in two G3 MB cell lines: MED8A and HDMB03. EIF2AK1, also known as HRI, was identified as one of the hits in the screen; it is an eIF2a kinase responsible for cellular response to oxidative stress. Phosphorylation of eIF2a is essential for canonical SG formation and global translation inhibition. We therefore used ISRIB, a known inhibitor of the integrated stress response, to block the effects of eIF2a phosphorylation, thus maintaining active global translation under stress conditions and preventing SG assembly. MB cells exposed to ISRIB combined with vincristine exhibited significantly decreased proliferation as well as increased apoptosis markers compared to cells exposed to vincristine alone. We show that combining SG inhibition with chemotherapy enhances the effects of the latter, which is increasingly relevant for patients suffering from therapy side effects and high chances of metastasis associated with G3 MB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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