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Enregistrement W2941036661 · doi:10.3389/fvets.2019.00207

Marmots and Yersinia pestis Strains in Two Plague Endemic Areas of Tien Shan Mountains

2019· article· en· W2941036661 sur OpenAlexfundno aff
Gulmira Sariyeva, Gulnara Bazarkanova, Ravshambek Maimulov, S. T. Abdikarimov, Berzhan Kurmanov, Aigul Abdirassilova, Антон Шабунин, Zaurbek Sagiyev, A. K. Dzhaparova, Ziyat Abdel, Raikhan Mussagaliyeva, Sergé Morand, Vladimir L. Motin, Michael Kosoy

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYersinia bacterium, plague, ectoparasites research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Science and Technology CenterGovernment of Canada
Mots-clésPlague (disease)Yersinia pestisBiologyYersiniosisVeterinary medicineFleaZoologyGeographyVirulenceEnterobacteriaceaeEscherichia coliMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The main purpose of this study was to clarify the role of gray marmots (Marmota baibacina) in the long-term maintenance of highly virulent strains of Yersinia pestis in two plague endemic foci of the Tien Shan Mountains in Kyrgyzstan. We present data from regular observations of populations of M. baibacina and small rodents cohabiting with marmots in the mountainous grasslands of the Sari-Dzhas (east of Issyk-Kul Lake) and the Upper-Naryn (south of Issyk-Kul Lake) natural foci. During 2012-2017, an abundance of marmots and their ectoparasites (fleas and ticks) was significantly higher in Upper-Naryn comparing to Sari-Dzhas, although there were no differences in a number and diversity of small rodents cohabiting with marmots. The plague bacterium was detected either in marmots or their ectoparasites collected during four of six years of observation in Sari-Dzhas and during two of four years of observation in Upper-Naryn. Plague was found in three sectors situated closely to each other in Sari-Dzhas and in one of eight repeatedly surveyed sectors in Upper-Naryn. During 6 years we isolated nine strains of Y. pestis from marmots, two from their fleas Oropsylla silantiewi, one from an unidentified tick, and one from the gray hamster (Cricetulus migratorius). All plague strains isolated from the rodents and their ectoparasites in this study were similar to Antiqua-biovar specific for marmots. The results indicate that plague can circulate continuously in the Tien Shan Mountains in populations of gray marmots and their ectoparasites with a facultative involvement of other rodent species after significant changes in rodent communities that happened in Kyrgyzstan during the previous two decades. The simultaneous field survey of two natural foci of plague, Sari-Dzhas and Upper-Naryn, would be important for further analysis of circulation of Y. pestis strains belonging to Antiqua biovar in the Tien Shan Mountains

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,553
Score d'incertitude au seuil0,659

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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