Virulence factor RNA transcript expression in the Leishmania Viannia subgenus: influence of species, isolate source, and Leishmania RNA virus-1
Notice bibliographique
Résumé
Leishmania RNA virus-1 (LRV1) is a double-stranded RNA virus identified in 20–25% of Viannia —species endemic to Latin America, and is believed to accelerate cutaneous to mucosal leishmaniasis over time. Our objective was to quantify known virulence factor (VF) RNA transcript expression according to LRV1 status, causative species, and isolate source. Eight cultured isolates of Leishmania were used, four of which were LRV1-positive ( Leishmania Viannia braziliensis [ n = 1], L . ( V .) guyanensis [ n = 1], L . ( V .) panamensis [ n = 2]), and four were LRV1-negative ( L . ( V .) panamensis [ n = 3], L . ( V .) braziliensis [ n = 1]). Promastigotes were inoculated into macrophage cultures, and harvested at 24 and 48 h. RNA transcript expression of hsp23 , hsp70 , hsp90 , hsp100 , mpi , cpb , and gp63 were quantified by qPCR. RNA transcript expression of hsp100 ( p = 0.012), cpb ( p = 0.016), and mpi ( p = 0.022) showed significant increases from baseline pure culture expression to 24- and 48-h post-macrophage infection, whereas hsp70 ( p = 0.004) was significantly decreased. A trend toward increased transcript expression of hsp100 at baseline in isolates of L . ( V .) panamensis was noted. Pooled VF RNA transcript expression by L . ( V .) panamensis isolates was lower than that of L . ( V .) braziliensis and L . ( V .) guyananesis at 24 h ( p = 0.03). VF RNA transcript expression did not differ by LRV1 status, or source of cultured isolate at baseline, 24, or 48 h; however, a trend toward increased VF RNA transcript expression of 2.71- and 1.93-fold change of mpi ( p = 0.11) and hsp90 (p = 0.11), respectively, in LRV1 negative isolates was noted. Similarly, a trend toward lower levels of overall VF RNA transcript expression in clinical isolates (1.15-fold change) compared to ATCC® strains at 24 h was noted ( p = 0.07). Our findings suggest that known VF RNA transcript expression may be affected by the process of macrophage infection. We were unable to demonstrate definitively that LRV-1 presence affected VF RNA transcript expression in the species and isolates studied. L . ( V .) guyanensis and L . ( V .) braziliensis demonstrated higher pooled VF RNA transcript expression than L . ( V .) panamensis ; however, further analyses of protein expression to corroborate this finding are warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».