Immune response‐related genes associated to blocking midgut dengue virus infection in <i>Aedes aegypti</i> strains that differ in susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
Aedes (Stegomyia) aegypti, the principal global vector of dengue viruses, has differences in its susceptibility to dengue virus infection. We compared the global expression of genes in the midguts of Colombian Ae. aegypti dengue-susceptible (Cali-S) and dengue-refractory (Cali-MIB) field derived strains after ingesting either a sugarmeal, a bloodmeal, or a bloodmeal containing dengue virus serotype 2 (DENV-2). Microarray-based transcriptome analysis among treatments indicated a total of 4725 transcripts with differential expression between the two strains. Eleven genes were selected from different functional groups based on their significant up or down expression levels as well as reports in the literature suggesting they are associated with dengue virus elimination. We measured mRNA abundance of these 11 genes at 0, 8, 24, and 36 h postinfection using quantitative real time PCR (qPCR) to confirm the microarray results and assess any temporal patterns. Four genes were selected (Gram-negative binding protein-GNBP [AAEL009176], Niemann Pick Type-C2-NPC2 [AAEL015136], Keratinocyte lectin [AAEL009842], and Cathepsin-b [AAEL007585]) for knockdown experiments using RNA interference (RNAi) methodology to determine the phenotype (DENV-2 susceptible or refractory). Silencing GNBP, Cathepsin-b and Keratinocyte lectin reduced the percentage of mosquitoes with disseminated virus in the Cali-S strain to 8%, 20%, and 12% respectively compared with 96% in the controls. Silencing of NPC2 increased the percentage of mosquitos with disseminated virus infections in Cali-MIB to 66% compared with 35% in the controls. This study provides insight into genes that may contribute to the Cali-S susceptible and Cali-MIB refractory phenotypes in Ae. aegypti.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».