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Enregistrement W2941465200 · doi:10.1111/his.13880

Analytical validation of a standardised scoring protocol for Ki67 immunohistochemistry on breast cancer excision whole sections: an international multicentre collaboration

2019· article· en· W2941465200 sur OpenAlexafffund
Samuel Leung, Torsten O. Nielsen, Lila Zabaglo, Indu Arun, Sunil Badve, Anita Bane, John M.S. Bartlett, Signe Borgquist, Martin C. Chang, Andrew Dodson, Anna Ehinger, Susan Fineberg, Cornelia M. Focke, Dongxia Gao, Allen M. Gown, Carolina Gutiérrez, Judith Hugh, Zuzana Kos, Anne‐Vibeke Lænkholm, Mauro G. Mastropasqua, Takuya Moriya, Sharon Nofech‐Mozes, C. Kent Osborne, Frédérique Penault‐Llorca, Tammy Piper, Takashi Sakatani, Roberto Salgado, Jane Starczynski, Tomoharu Sugie, Bert van der Vegt, Giuseppe Viale, Daniel F. Hayes, Lisa M. McShane, Mitch Dowsett

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreOttawa HospitalUniversity of OttawaUniversity of AlbertaOntario Institute for Cancer ResearchMcMaster UniversityJuravinski HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCure Brain Cancer FoundationNational Institute for Health and Care ResearchNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchGovernment of OntarioOntario Institute for Cancer ResearchBreakthrough Breast CancerBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésBreast cancerMedicineImmunohistochemistryProtocol (science)PathologyMedical physicsCancerOncologyInternal medicineAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The nuclear proliferation marker Ki67 assayed by immunohistochemistry has multiple potential uses in breast cancer, but an unacceptable level of interlaboratory variability has hampered its clinical utility. The International Ki67 in Breast Cancer Working Group has undertaken a systematic programme to determine whether Ki67 measurement can be analytically validated and standardised among laboratories. This study addresses whether acceptable scoring reproducibility can be achieved on excision whole sections. METHODS AND RESULTS: breast cancers were centrally stained for Ki67 and sections were circulated among 23 pathologists in 12 countries. All pathologists scored Ki67 by two methods: (i) global: four fields of 100 tumour cells each were selected to reflect observed heterogeneity in nuclear staining; (ii) hot-spot: the field with highest apparent Ki67 index was selected and up to 500 cells scored. The intraclass correlation coefficient (ICC) for the global method [confidence interval (CI) = 0.87; 95% CI = 0.799-0.93] marginally met the prespecified success criterion (lower 95% CI ≥ 0.8), while the ICC for the hot-spot method (0.83; 95% CI = 0.74-0.90) did not. Visually, interobserver concordance in location of selected hot-spots varies between cases. The median times for scoring were 9 and 6 min for global and hot-spot methods, respectively. CONCLUSIONS: The global scoring method demonstrates adequate reproducibility to warrant next steps towards evaluation for technical and clinical validity in appropriate cohorts of cases. The time taken for scoring by either method is practical using counting software we are making publicly available. Establishment of external quality assessment schemes is likely to improve the reproducibility between laboratories further.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,243
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,155
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,243
Score d'incertitude au seuil0,933

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2430,155
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0050,006
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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