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Enregistrement W2941821118 · doi:10.1186/s12866-019-1438-2

Development of flow cytometry based adherence assay for Neisseria gonorrhoeae using 5′-carboxyfluorosceinsuccidyl ester

2019· article· en· W2941821118 sur OpenAlexafffund
Sidharath Dev Thakur, Milan Obradović, Jo‐Anne R. Dillon, Siew Hon Ng, Heather L. Wilson

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Health Research FoundationUniversity of Saskatchewan
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeBiologyFlow cytometryMicrobiologyParasitologyImmunologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Neisseria gonorrhoeae is an obligate human pathogen and its adherence to host cells is essential for its pathogenesis. Gonococcal adherence assays are based on the enumeration of bacteria attached to human cells on solid media. Because conventional adherence assays are based on bacterial counts, they are often time consuming to perform and prone to observer bias. A flow cytometry based method, using the cell-permeable fluorescent dye 5'-carboxyfluoroscein succidyl ester (CFSE), was developed to dramatically increase the number of adherent N. gonorrhoeae quantified per assay while improving repeatability and removing observer bias. Piliated N. gonorrhoeae F62 were stained with CFSE then the staining reaction was quenched with foetal bovine serum. Human cervical ME-180 cells were infected with CFSE-stained N. gonorrhoeae (multiplicity of the infection 100:1) for 2 h. Infected cells were washed to remove loosely adhered bacteria. Flow cytometry was used to quantify the percentage of ME-180 cells associated with CFSE-stained N. gonorrhoeae and a minimum of 30,000 events were recorded. Real time-PCR analysis targeting opa gene (encoding N. gonorrhoeae opacity associated gonococcal outer membrane protein) was performed on infected ME-180 cells to confirm the flow cytometric adherence assay results. A rabbit was immunized with heat-killed N. gonorrhoeaeF62 to generate hyperimmune serum. The functional compatibility of the assay was confirmed by studying the effect of N. gonorrhoeae F62 antiserum on blocking adherence/invasion of CFSE-stained bacteria to ME-180 cells. RESULTS: We observed that 20.3% (+/- 1.0) ME-180 cells were associated with CFSE-stained N. gonorrhoeae. Heat-inactivated hyperimmune serum, at 1:10 to 1:80 dilutions, significantly inhibited gonococcal adherence by 6 and 3 fold, respectively. Real time-PCR analysis targeting opa gene confirmed that hyperimmune serum blocked adherence/invasion of N. gonorrhoeae to the ME-180 cells in a dilution-dependent manner. CONCLUSIONS: Flow cytometric analysis was amenable to quick, easy and high-throughput quantification of the association of N. gonorrhoeae with ME-180 cells and was functionally confirmed using PCR analysis. These approaches may be adapted for in vitro and in vivo adherence studies related to gonococcal pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,082
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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