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Enregistrement W2941875587 · doi:10.1093/neuonc/noz036.247

TMOD-09. TUMOR ASSOCIATED MACROPHAGE DYNAMICS IN PEDIATRIC HIGH-GRADE GLIOMAS

2019· article· en· W2941875587 sur OpenAlexaff
James Ross, Zhihong Chen, Frank Szulzewsky, Lenore Monterroza, Matthew Schniederjan, Oren J. Becher, Dolores Hambardzumyan

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDynamics (music)MacrophageGliomaMedicineCancer researchBiologyPsychologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pediatric high-grade gliomas (pHGG) drastically differ from their adult counterparts in terms of genetic and epigenetic alterations, suggesting they may also differ in the constituency of their tumor microenvironment. It is known tumor associated macrophages (TAMs) can constitute up to 30–40% of the total tumor cell mass in adult high-grade gliomas, yet little is known for pHGGs. This raises the question of whether pHGGs possess a distinct constituency of TAMs due to their unique genetic and epigenetic landscapes. To uncover the composition and behavior of TAMs in pHGG we utilize RCAS/tva, a somatic cell-type specific gene transfer system in which we administer RCAS-PDGFA or RCAS-PDGFB to Nestin-positive cells in the brain of immunocompetent Cdkn2a knockout mice. We observe PDGFB-driven tumors have a significantly lower median survival compared to PDGFA-driven tumors. PDGFB tumors also have increased infiltration of TAMs, made evident by immunohistochemical staining for IBA1. Flow cytometry indicates the increased number of TAMs is due to bone-marrow derived inflammatory monocytes, not the microglial population. Unsupervised clustering and principle component analysis indicates these tumors possess distinct expression profiles. Several chemokines and receptors are highly expressed in PDGFB tumors such as Ccl2, Ccl3, and Ccl7, suggesting chemokine mediated infiltration of TAMs may be occurring. To study PDGF signaling and TAM infiltration in human pHGGs, we stained over 40 tumors for IBA1, PDGF-receptors, and PDGF-ligands. There is a positive correlation between PDGFRβ, PDGFB, and CD31 staining with IBA1, suggesting a stromal role exists for the infiltration of TAMs. Current in vivo studies are being conducted to determine if TAM infiltration can be inhibited by genetically or pharmacologically targeting chemokine signaling pathways. In vivo and in vitro studies are also being performed to determine which cell types are the main sources of chemokines and inflammatory molecules are in the microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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