Transcriptome Changes in the Mink Uterus during Blastocyst Dormancy and Reactivation
Notice bibliographique
Résumé
Embryo implantation in the mink follows the pattern of many carnivores, in that preimplantation embryo diapause occurs in every gestation. Details of the gene expression and regulatory networks that terminate embryo diapause remain poorly understood. Illumina RNA-Seq was used to analyze global gene expression changes in the mink uterus during embryo diapause and activation leading to implantation. More than 50 million high quality reads were generated, and assembled into 170,984 unigenes. A total of 1684 differential expressed genes (DEGs) in uteri with blastocysts in diapause were compared to the activated embryo group (p < 0.05). Among these transcripts, 1527 were annotated as known genes, including 963 up-regulated and 564 down-regulated genes. The gene ontology terms for the observed DEGs, included cellular communication, phosphatase activity, extracellular matrix and G-protein couple receptor activity. The KEGG pathways, including PI3K-Akt signaling pathway, focal adhesion and extracellular matrix (ECM)-receptor interactions were the most enriched. A protein-protein interaction (PPI) network was constructed, and hub nodes such as VEGFA, EGF, AKT, IGF1, PIK3C and CCND1 with high degrees of connectivity represent gene clusters expected to play an important role in embryo activation. These results provide novel information for understanding the molecular mechanisms of maternal regulation of embryo activation in mink.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».