MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2942051880 · doi:10.1128/jvi.00179-19

Subclinical Cytomegalovirus DNA Is Associated with CD4 T Cell Activation and Impaired CD8 T Cell CD107a Expression in People Living with HIV despite Early Antiretroviral Therapy

2019· article· en· W2942051880 sur OpenAlexaff
Aaron Christensen-Quick, Marta Massanella, Andrew Frick, Stephen A. Rawlings, Celsa A. Spina, Milenka Vargas-Meneses, Rachel Schrier, Masato Nakazawa, Christy M. Anderson, Sara Gianella

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute on Drug AbuseCalifornia HIV/AIDS Research ProgramNational Institute of Mental HealthNational Institutes of Health
Mots-clésBiologySubclinical infectionDegranulationImmune systemCD8ImmunologyCytotoxic T cellVirologyViral replicationT cellViral loadCytomegalovirusVirusViral diseaseHerpesviridae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic viral infections such as with HIV and CMV last a lifetime and can continually antagonize the immune system. Both viruses are associated with higher expression of inflammation markers, and recent evidence suggests that CMV may complicate efforts to deplete HIV reservoirs. Our group and others have shown that CMV shedding is associated with a larger HIV reservoir. Subclinical CMV replication could favor HIV persistence via bystander effects on our immune system. In this study, we collected longitudinal PBMC samples from people starting ART and measured immune changes associated with detectable CMV. We found that when CMV was detectable, CD4+T cell activation was higher and CD8+T cell degranulation was lower. Both results may contribute to the slower decay of the size of the reservoir during CMV replication, since activated CD4+T cells are more vulnerable to HIV infection, while the loss of CD8+T cell degranulation may impede the proper killing of infected cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of VirologyMême sujetCytomegalovirus and herpesvirus researchTravaux en français237 207