MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2942071564 · doi:10.1093/neuonc/noz036.043

DIPG-22. GENETIC MODELING IMPLICATES RAS AND MYC AS KEY EPIGENETICALLY ACTIVATED TRANSCRIPTIONAL TARGETS OF H3K27M-DRIVEN CANCER

2019· article· en· W2942071564 sur OpenAlexaff
Robert Siddaway, Sanja Pajovic, Byungjin Kim, Scott Ryall, Sameer Agnihotri, Christopher Li, Cynthia Hawkins

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchCarcinogenesisBiologyEpigeneticsDownregulation and upregulationAstrocyteDNA methylationTranscriptomeCancerGene expressionGeneGeneticsNeuroscienceCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Histone 3 mutations at lysine 27 (H3K27M) are frequent drivers of midline gliomagenesis, occurring in ~80% of diffuse intrinsic pontine gliomas (DIPG) and leading to widespread H3K27me3 changes through PRC2 inhibition. Although H3K27M mutations appear to cooperate with additional mutations including TP53 and PDGFRA, the exact oncogenic function of H3K27M is unknown, and in vivo models have not yielded tumors driven by H3K27M alone. Here we created a genetic mouse model by microinjection, expressing H3.3K27M under control of the Fabp7 promoter, which is active in the brain from approximately E14.5, primarily in radial glia and astrocyte precursors, but also allows expression in non-brain developing and adult tissues. H3.3K27M expression in the developing brainstem led to SOX10 upregulation via loss of H3K27me3 at the Sox10 promoter, resulting in an expression profile consistent with K27M-mutant DIPG, including an oligodendrocyte precursor cell (OPC) signature along with RAS and EMT activation. H3.3K27M induced tumors in multiple organs that were driven by K27M alone and, when combined with Trp53 loss, led to primary high-grade gliomas. The tumors had a cell-type independent expression signature featuring RAS and MYC activation, which overlapped with human DIPG and pointed to a core K27M transcriptome. Furthermore, as in human DIPG, mouse tumors spontaneously mutated the RAS pathway and MYC to lock in pathway activation. Our data suggest that RAS and MYC are core pathways that will need to be targeted in order to effectively treat this devastating disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuro-OncologyMême sujetGlioma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207