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Enregistrement W2942081042 · doi:10.1093/neuonc/noz036.017

BIOL-04. DISTAL-LESS/DLX2 HOMEOBOX GENE REGULATION OF CHEMOKINE RECEPTOR CXCR4 - ROLE IN MIGRATION IN FOREBRAIN DEVELOPMENT AND CNS TUMORS

2019· article· en· W2942081042 sur OpenAlexaff
Sara Japoni, Xiaohua Song, Roger Leng, David D. Eisenstat

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyChromatin immunoprecipitationHomeoboxChemokine receptorPromoterDLX5Homeobox A1Transcription factorGanglionic eminenceGene knockdownCell biologyProgenitor cellGeneticsGeneGene expressionReceptorStem cellChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) have an extremely poor prognosis. Mutations of the genes encoding histone H3K27, especially H3K27M, are highly prevalent. There is reduced expression of the homeobox gene Dlx2 in DIPG with H3K27M mutations. Single cell RNA sequencing suggests that the cell of origin is an oligodendroglial progenitor cell (OPC). DLX2 transcription factors promote GABAergic interneuron differentiation and tangential migration to the neocortex from basal forebrain structures such as the ganglionic eminences (GE) where neural progenitors and OPC both derive. We and others have demonstrated that DLX transcription factors repress OPC differentiation while activating gene networks required for interneuron differentiation and migration. We are exploring the embryonic forebrain and DIPG microenvironment and specifically the role of DLX2 regulation of CXCR4, the receptor for the chemokine CXCL12 essential for interneuron migration. RESULTS: Using chromatin immunoprecipitation of E13.5 mouse GE and our specific polyclonal DLX2 antibody, we isolated seven regions of the Cxcr4 gene promoter occupied by DLX2 in vivo. Subsequently, using electrophoretic mobility shift assays (EMSA), we determined that DLX2 specifically bound to five of these regions containing candidate homeodomain DNA binding sites in vitro. Co-transfection of Dlx2 with a luciferase reporter construct linked to these EMSA (+) Crxcr4 promoter elements demonstrated activation of 4 regions. There was significant loss of Cxcr4 expression in the forebrains of Dlx1/Dlx2 double knockout (DKO) mice. SiRNA knockdown (KD) of Dlx2 significantly reduced Cxcr4 expression in vitro. Cell migration was significantly decreased in the presence of CXCL12 either by Dlx2 KD or by using plerixafor, a CXCR4 signaling inhibitor. CONCLUSIONS: DLX2 binds to the Crxr4 promoter and activates its expression. Pharmacological regulation of CXCR4 signaling may be an important avenue to pursue towards blocking OPC-like DIPG migration and invasion in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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