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Enregistrement W2942162969 · doi:10.1038/s41598-019-42671-3

Selection of high affinity aptamer-ligand for dexamethasone and its electrochemical biosensor

2019· article· en· W2942162969 sur OpenAlexafffund
Somia Mehennaoui, Sujittra Poorahong, Gastón Contreras Jiménez, Mohamed Siaj

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésAptamerBiosensorDexamethasoneLigand (biochemistry)Selection (genetic algorithm)ElectrochemistryChemistryComputational biologyCombinatorial chemistryComputer scienceBiochemistryMolecular biologyBiologyMedicineInternal medicineElectrodeReceptorArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A high specificity aptamer-ligand biorecognition and binding system to monitor of dexamethasone (DXN) was developed. The detection principle was based on a label-free electrochemical aptasensor. The selection of the aptamer was successfully performed by the systematic evolution of ligands through exponential enrichment technique (SELEX). From a random library of 1.08 × 10 15 single-stranded DNA, an aptamer designated as DEX04 showed a highest affinity with a dissociation constant of 18.35 nM. It also showed a good conformational change when binding with DXN. In addition, the aptamer DEX04 did not show any cross-reactivity with other commonly used hormones. An impedimetric aptasensor for DXN was then developed by immobilizing DEX04 on a gold electrode. The binding upon to DXN was monitored by following the change in the charge transfer resistance (Rct) of the [Fe(CN) 6 ] 4−/3− redox couple. The aptasensor exhibited a linear range from 2.5 to 100 nM with a detection limit of 2.12 nM. When applied aptasensor to test in water samples, it showed good recovery percentages. The new DXN aptamer can be employed in other biosensing applications for food control and the diagnosis of some diseases in medicine as a cost-effective, sensitive and rapid detection method.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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