DNA metabarcoding reveals the broad and flexible diet of a declining aerial insectivore
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Aerial insectivores are highly mobile predators that feed on diverse prey items that have highly variable distributions. As such, investigating the diet, prey selection and prey availability of aerial insectivores can be challenging. In this study, we used an integrated DNA barcoding method to investigate the diet and food supply of Barn Swallows, an aerial insectivore whose North American population has declined over the past 40 yr. We tested the hypotheses that Barn Swallows are generalist insectivores when provisioning their young and select prey based on size. We predicted that the diets of nestlings would contain a range of insect taxa but would be biased towards large prey items and that the diet of nestlings would change as prey availability changed. We collected insects using Malaise traps at 10 breeding sites and identified specimens using standard DNA barcoding. The sequences from these insect specimens were used to create a custom reference database of prey species and their relative sizes for our study area. We identified insect prey items from nestling fecal samples by using high-throughput DNA sequencing and comparing the sequences to our custom reference database. Barn Swallows fed nestlings prey items from 130 families representing 13 orders but showed selection for larger prey items that were predominantly from 7 dipteran families. Nestling diet varied both within and between breeding seasons as well as between breeding sites. This dietary flexibility suggests that Barn Swallows are able to adjust their provisioning to changing prey availability on the breeding grounds when feeding their nestlings. Our study demonstrates the utility of custom reference databases for linking the abundance and size of insect prey in the habitat with prey consumed when employing molecular methods for dietary analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».