Quantitative proteomics identifies novel PIAS1 substrates involved in cell migration and motility
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The Protein Inhibitor of Activated STAT 1 (PIAS1) is an E3 SUMO ligase that plays important roles in various cellular pathways, including STAT signaling, p53 pathway, and the steroid hormone signaling pathway. PIAS1 can SUMOylate PML (at Lys-65 and Lys-160) and PML-RARα promoting their ubiquitin-mediated degradation. Increasing evidence shows that PIAS1 is overexpressed in various human malignancies, including prostate and lung cancers. To understand the mechanism of action of PIAS1, we developed a quantitative SUMO proteomic approach to identify potential substrates of PIAS1 in a system-wide manner. Our analyses enabled the profiling of 983 SUMO sites on 544 proteins, of which 204 SUMO sites on 123 proteins were identified as putative PIAS1 substrates. These substrates are involved in different cellular processes, such as transcriptional regulation, DNA binding and cytoskeleton dynamics. Further functional studies on Vimentin (VIM), a type III intermediate filament protein involved in cytoskeleton organization and cell motility, revealed that PIAS1 exerts its effects on cell migration and cell invasion through the SUMOylation of VIM at Lys-439 and Lys-445 residues. VIM SUMOylation was necessary for its dynamic disassembly, and cells expressing a non-SUMOylatable VIM mutant showed reduced levels of proliferation and migration. Our approach not only provides a novel strategy for the identification of E3 SUMO ligase substrates, but also yields valuable biological insights into the unsuspected role of PIAS1 and VIM SUMOylation on cell motility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».