Freezing Tolerance of Thermophilic Bacterial Endospores in Marine Sediments
Notice bibliographique
Résumé
Dormant endospores of anaerobic, thermophilic bacteria found in cold marine sediments offer a useful model for studying microbial biogeography, dispersal, and survival. The dormant endospore phenotype confers resistance to unfavourable environmental conditions, allowing dispersal to be isolated and studied independently of other factors such as environmental selection. To study the resilience of thermospores to conditions relevant for survival in extreme cold conditions, their viability following different freezing treatments was tested. Marine sediment was frozen at either -80°C or -20°C for ten days prior to pasteurization and incubation at +50°C for 21 days to assess thermospore viability. Sulfate reduction commenced at +50°C following both freezing pretreatments indicating persistence of thermophilic endospores of sulfate-reducing bacteria. The onset of sulfate reduction at +50°C was delayed in -80°C pretreated microcosms, which exhibited more variability between triplicates, compared to -20°C pretreated microcosms and parallel controls that were not frozen in advance. Microbial communities were evaluated by 16S rRNA gene amplicon sequencing, revealing an increase in the relative sequence abundance of thermophilic endospore-forming Firmicutes in all microcosms. Different freezing pretreatments (-80°C and -20°C) did not appreciably influence the shift in overall bacterial community composition that occurred during the +50°C incubations. Communities that had been frozen prior to +50°C incubation showed an increase in the relative sequence abundance of OTUs affiliated with the class Bacilli, relative to unfrozen controls. These results show that freezing impacts but does not obliterate thermospore populations and their ability to germinate and grow under appropriate conditions. Indeed the majority of the thermospore OTUs detected in this study (21 of 22) could be observed following one or both freezing treatments. These results are important for assessing thermospore viability in frozen samples and following cold exposure such as the very low temperatures that would be encountered during panspermia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».