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Enregistrement W2942973205 · doi:10.3389/fmicb.2019.00929

Microbiology and Nitrogen Cycle in the Benthic Sediments of a Glacial Oligotrophic Deep Andean Lake as Analog of Ancient Martian Lake-Beds

2019· article· en· W2942973205 sur OpenAlexaff
Vı́ctor Parro, Fernando Puente‐Sánchez, Nathalie A. Cabrol, Ignacio Gallardo-Carreño, Mercedes Moreno‐Paz, Yolanda Blanco, Miriam García‐Villadangos, Cristian Tambley, Virginie Tilot, Cody Thompson, Eric Smith, P. Sobrón, Cecilia Demergasso, Alex Echeverría-Vega, Miguel Ángel Fernández-Martínez, Lyle G. Whyte, Alberto González Fairén

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNational Aeronautics and Space AdministrationNASA Astrobiology InstituteMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaMinisterio de Economía y CompetitividadEuropean Regional Development Fund
Mots-clésWater columnBenthic zoneNitrogen cycleEcologyBiogeochemical cycleThaumarchaeotaEnvironmental chemistryArchaeaAnammoxOceanographyBiologyDenitrificationChemistryGeologyNitrogenBacteriaDenitrifying bacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Potential benthic habitats of early Mars lakes, probably oligotrophic, could range from hydrothermal to cold sediments. Dynamic processes in the water column (such as turbidity or UV penetration) as well as in the benthic bed (temperature gradients, turbation, or sedimentation rate) contribute to supply nutrients to a potential microbial ecosystem. High altitude, oligotrophic, and deep Andean lakes with active deglaciation processes and recent or past volcanic activity are natural models to assess the feasibility of life in other planetary lake/ocean environments and to develop technology for their exploration. We sampled the benthic sediments (down to 269 m depth) of the oligotrophic lake Laguna Negra (Central Andes, Chile) to investigate its ecosystem through geochemical, biomarker profiling, and molecular ecology studies. The chemistry of the benthic water was similar to the rest of the water column, except for variable amounts of ammonium (up to 2.8 ppm) and nitrate (up to 0.13 ppm). A life detector chip (LDChip) with a 300-antibody microarray revealed the presence of biomass in the form of exopolysaccharides (EPS) and other microbial markers associated to several phylogenetic groups and potential microaerobic and anaerobic metabolisms such as nitrate reduction. DNA analyses showed that 19% of the Archaea sequences corresponded to a group of ammonia-oxidizing archaea (AOA) similar (97%) to Nitrosopumilus spp. (Thaumarchaeota), and 9% of Bacteria sequences to nitrite-oxidizing bacteria (NOB) from the Nitrospira genus, suggesting a coupling between ammonia and nitrite oxidation. Mesocosm experiments with the specific AOA inhibitor 2-Phenyl-4,4,5,5-tetramethylimidazoline-1-oxyl 3-oxide (PTIO) demonstrated an AOA-associated ammonia oxidation activity with the simultaneous accumulation of nitrate and sulfate. The results showed a rich benthic microbial community dominated by microaerobic and anaerobic metabolisms thriving under aphotic, low temperature (4ºC), and relatively high pressure, that might be a suitable terrestrial analogue other planetary settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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