İnsan Metilentetrahidrofolat Redüktaz Enziminin Kristal Yapısı İçin Bir Model
Notice bibliographique
Résumé
Amac: Okaryotik metilentetrahidrofolat reduktaz enzimi (MTHFR) olarak bilinen ve total olarak 656 aminoasitten olusan bu enzim homodimer yapidadir. Her unitesi katalitik ve duzenleyici bolgelerden olusmaktadir. MTHFR enzminin katalitik olarak aktivite gosterebilmesi icin flavin-adenin dinukleotid (FAD)'in MTHFR'ye nonkovalent olarak baglanmasi gerekmektedir. Insan MTHFR enziminin geni kromozom 1p36.3'te lokalizedir. Genin dorduncu ekzonunda yerlesmis olan MTHFR 677 C>T polimorfizmi, proteinin 222. kodonundaki alaninin valine (Ala222Val) donusumune neden olmaktadir. Insan MTHFR proteini icin, proteinin kristal yapisinin ortaya koyulmasi ile ilgili bir calisma olmamasi nedeniyle, bu calisma ile MTHFR proteininin kristal yapisi hakkinda bir model olusturmayi amacladik. Ayrica MTHFR677 C>T polimorfizmi neticesinde ortaya cikan Ala222Val degisikliginin insan MTHFR enziminin kristal yapisinda olusturdugu degisiklikleri ortaya koymayi hedefledik. Metod: Bu amacla, molekuler modelleme teknikleri olarak MOE bilgisayar programi (versiyon 2013.0801, Chemical Computing Group Inc., Montreal, Kanada) kullandik. Bulgular: Insandaki MTHFR enzimi ile FAD arasindaki baglarin Tyr50, Gly108, Asp109, Tyr149, Arg107, Ala127, Lys169 Tyr126, His153 ve His165 aminoasitleri uzerinden oldugunu, Tyr126 ve His165 arasindaki cift bagin FAD'i sikistirma ozelligi olabilecegini gorduk. Sonuc: Sonuc olarak, insan MTHFR enziminin kristal yapisi hakkinda bir model ortaya koyuldu ve Ala222Val degisikliginin FAD baglanma durumunu etkilemesi yuzunden, enzim aktivitesine etki ettigi tespit edildi.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,012 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».