Antimicrobial Use and Antimicrobial Resistance Indicators—Integration of Farm-Level Surveillance Data From Broiler Chickens and Turkeys in British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Using data from a Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS), we aimed to describe trends in antimicrobial use (AMU) in broiler chickens and turkeys, to compare AMU across species, to compare with trends in antimicrobial resistance (AMR), and to assess the effects of various AMU/AMR units of measurement (metrics and indicators) on data integration. Data on AMU/AMR in enteric bacteria, collected from 2013 to 2017 from broiler chickens (n=143 flocks) and turkeys (n=145) were used. In broiler chickens, the total AMU in milligrams/population correction unit (mg/PCU) decreased by 6%, the number (n) of defined daily doses for animals using Canadian standards (nDDDvetCA) per 1,000 broiler chicken-days decreased by 12%, and nDDDvetCA/PCU decreased by 6%. In turkeys, the mg/PCU decreased by 1%, whereas the nDDDvetCA/1,000 turkey-days and the nDDDvetCA/PCU increased by 1% and 5%, respectively. The types of antimicrobial classes used in both species were similar. Using the frequency of flocks reporting use (i.e., number of flocks reporting use/number of flocks participating) as a measurement, the use of certain antimicrobials changed over time (e.g., Broilers, decreased cephalosporin use, virginiamycin use, emerging use of lincomycin-spectinomycin and avilamycin; Turkeys: increased trimethoprim-sulfonamides and macrolide use). The trends in resistance to specific antimicrobials paralleled the frequency and quantity of use (e.g., ceftriaxone use decreased - ceftriaxone resistance decreased, and gentamicin use increased - gentamicin resistance increased) in some situations, but not others (decreased fluoroquinolone use - increased ciprofloxacin resistance). AMR data were summarized using the AMR indicator index (AMR Ix). The most notable AMR Ix trend was the decrease in ceftriaxone AMR Ix among Escherichia coli (0.19 to 0.07); indicative of the success of the poultry industry action to eliminate the preventive use of third generation cephalosporins. Other trends observed were the increase in ciprofloxacin AMR Ix among Campylobacter from 0.23 to 0.41 and gentamicin AMR Ix among E. coli from 0.11 to 0.22, suggestive of the persistence/emergence of resistance related to previous and current AMU not captured in our surveillance timeframe. These data highlight the necessity of multiple AMU and AMR indicators for monitoring the impact of stewardship activities and interventions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».