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Enregistrement W2943287766 · doi:10.3389/fpls.2019.00562

GmMYB176 Regulates Multiple Steps in Isoflavonoid Biosynthesis in Soybean

2019· article· en· W2943287766 sur OpenAlex
Arun Kumaran Anguraj Vadivel, Justin B. Renaud, Sateesh Kagale, Sangeeta Dhaubhadel

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensSaskatchewan Research Council (Canada)Agriculture and Agri-Food CanadaNational Research Council CanadaWestern University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIsoflavonoidChalcone synthaseFlavonoid biosynthesisMYBBiologyBiosynthesisTranscriptomeGeneSecondary metaboliteGene expressionRhizobiaBiochemistryRNA interferencePlant defense against herbivoryFlavonoidGeneticsRNASymbiosisBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isoflavonoids are a group of plant natural compounds synthesized almost exclusively by legumes, and are abundant in soybean seeds and roots. They play important roles in plant-microbial interactions and the induction of nod gene expression in Rhizobia that form nitrogen-fixing nodules on soybean roots. Isoflavonoids also contribute to the positive health effects associated with soybean consumption by humans and animals. An R1 MYB transcription factor GmMYB176 regulates isoflavonoid biosynthesis by activating chalcone synthase (CHS)8 gene expression in soybean. Using a combination of transcriptomic and metabolomic analyses of GmMYB176-RNAi silenced (GmMYB176-Si), GmMYB176-overexpressed (GmMYB176-OE), and control soybean hairy roots, we identified a total of 33 differentially expressed genes (DEGs) and 995 differentially produced metabolite features (DPMF) in GmMYB176-Si hairy roots, and 5727 DEGs and 149 DPMFs in GmMYB176-OE hairy roots. By a targeted approach, 25 isoflavonoid biosynthetic genes and 6 metabolites were identified as differentially regulated in GmMYB176-OE and GmMYB176-Si soybean hairy roots. Taken together, our results demonstrate the complexity of isoflavonoid biosynthesis in soybean roots and suggest that a coordinated expression of pathway genes, substrate flux and product threshold level may contribute to the dynamic of the pathway regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,305
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle