Antibacterial activities of Propionibacterium acnes bacteriophages against a diverse collection of P. acnes clinical isolates: prospects for novel alternative therapies for acne vulgaris
Notice bibliographique
Résumé
A total of 136 chronically infected Canadian acne patients from Ottawa-Gatineau and Northeastern Ontario regions accounting for 75% of subjects (12-50 years old, with 90th percentile at the age of 30) who had suffered acne vulgaris (with various acne related scarring) for a median duration of 4 years, were sources for isolation of Propionibacterium acnes, the etiologic agent for acne vulgaris. Eighty-four percent of patients were subjected to various treatment regimens with topical and systemic agents including in combination with 1-3 different types of antibiotics (mean duration of 7 months). A diverse collection of 224 clinical P. acnes isolates from Canadian and Swedish subjects were characterized for their sensitivities to infection by a Canadian collection of 67 diverse phages belonging to siphoviridae; and multiple minimal cocktails consisting of 2-3 phages were formulated to be effective on global P. acnes isolates. Propionibacterium acnes isolates were characterized by multiplex PCR to belong to phylotypes IA, IB and II, which also showed resistance against commonly used antibiotics for treating acne vulgaris (overall resistance rate of 9.5%), were sensitive to phages regardless of their type and antibiotic resistance patterns, providing ground for phages as novel alternative therapeutics for future in vivo trials. The phage collection was diverse by virtue of their BamHI restriction patterns and full genome sequences and harboured a major tail protein (MTP) that appeared to be important in contributing to their host ranges. Three dimensional structural modeling of the N-domain of P. acnes MTPs implicated previously unreported involvement of the α1-β4 loop (C5 loop) within N-domain amino acid sequence in contributing to the expanded host range of a mutant phage to infect a naturally phage resistant P. acnes clinical isolate. Given the potential of phages for rapid mutational diversification surpassing that of their bacterial hosts and the fact that phages are generally regarded as safe (GRAS), rapid and cost-effective derivation of mutant phages with expanded host ranges provide a strong framework forimproving phage cocktails for use in future personalized medicine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».