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Enregistrement W2943711855 · doi:10.1002/wrna.1540

Alternative polyadenylation and the stress response

2019· review· en· W2943711855 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueWiley Interdisciplinary Reviews - RNA · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPolyadenylationBiologyRNARNA splicingCellular stress responseTranslation (biology)Gene expressionMessenger RNACell biologyRNA-binding proteinRegulation of gene expressionHeat shockAlternative splicingGeneComputational biologyGeneticsHeat shock proteinFight-or-flight response

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cellular stress response is a universal mechanism necessary for the survival of all organisms. This multifaceted process is primarily driven by regulation of gene expression to produce an intracellular environment suitable for promoting cell survival and recovery. Posttranscriptional regulatory events are considered as critical mechanisms that modulate core characteristics of mRNA transcripts to promote cell adaptation to various assaults. While the impact of processes such as mRNA splicing, turnover, localization, and translation on the cellular stress response has been extensively studied, recent observations highlight the role of alternative polyadenylation (APA) in response to challenges such as oxidative stress, heat shock, and starvation. The role of APA is comprehensive with far reaching effects on mRNA stability, mRNA localization, and protein coding sequences. Nonetheless, APA remains a relatively unappreciated mode of gene regulation despite its role in regulating key mediators of the stress response. The goal of this review is to provide an overview of the recent advances in our understanding of the various ways by which APA affects cell adaptation to its environment and discuss how a defect in APA could have deleterious consequences on cell survival. This article is categorized under: RNA in Disease and Development > RNA in Disease RNA Structure and Dynamics > Influence of RNA Structure in Biological Systems RNA Processing > 3' End Processing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle