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Enregistrement W2943816618 · doi:10.1161/atvb.36.suppl_1.546

Abstract 546: Characterization of the I4399M Variant of Apolipoprotein(a): Implications for Altered Prothrombotic Properties of Lipoprotein(a)

2016· article· en· W2943816618 sur OpenAlexaff
Jackson McAiney, Corey A. Scipione, Daniel Simard, James W. Gauld, Michael B. Boffa, Marlys L. Koschinsky

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLipoprotein(a)Apolipoprotein BChemistryLipoproteinProteaseBiochemistryMolecular biologyPopulationFibrinogenGlycoproteinFibrinBiologyMedicineImmunologyEnzymeCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated plasma levels of lipoprotein(a) (Lp(a)) are a causal risk factor for CHD. Lp(a) closely resembles LDL, but contains an additional glycoprotein apolipoprotein(a) (apo(a)) that is structurally homologous to the fibrinolytic proenzyme plasminogen. Key sequence differences render the protease-like domain in apo(a) catalytically inactive. This has led to speculation that Lp(a) can oppose the fibrinolytic functions of plasminogen. A single nucleotide polymorphism (SNP) in the LPA gene encoding apo(a) results in an Ile to Met substitution at position 4399 in the protease-like domain. In population studies, this variant has been correlated with elevated plasma Lp(a) levels and with higher CHD risk, an effect that has been suggested to arise from effects of the variant on fibrin clot properties. We undertook a functional characterization of the effect of the I4399M substitution in apo(a). Molecular dynamics simulations of wild-type (wt) apo(a) and the Met variant revealed a shift from a buried (Ile) to slightly exposed (Met) environment, allowing for potential modification of the Met. Indeed, MALDI-TOF mass spectrometry analysis demonstrated the presence of a methionine sulfoxide moiety at this position in the Met variant. When 17-kringle recombinant forms of apo(a) were included in a plasma clot lysis assay, both the wt apo(a) and Met variant inhibited lysis, but the Met variant had a 50% greater effect. However, the Met variant was equally as efficient as wt apo(a) in inhibiting plasminogen activation on a fibrin surface. Apo(a) was also able to significantly shorten coagulation time for clots made from either purified fibrin or lipoprotein-deficient plasma, with the Met variant having twice as large an effect as wt apo(a). Morever, the Met variant resulted in greater turbidity of the clots whereas wt apo(a) had no effect. In agreement with these findings, SEM and confocal microscopy of fibrin clots showed that compared to wt apo(a), the I4399M variant resulted in significant alteration of the fibrin network, with a 4-fold increase in fibrin fiber width. Together, our data suggest that the Met4399 variant differs structurally from wt apo(a), which may underlie key differences related to its effects on fibrin clot architecture and fibrinolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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