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Enregistrement W2943886463 · doi:10.1101/629618

Androgen-regulated transcription of <i>ESRP2</i> drives alternative splicing patterns in prostate cancer

2019· preprint· en· W2943886463 sur OpenAlexafffund
Jennifer Munkley, Ling Li, Subha Krishnan, Gerald Hysenaj, Emma Scott, Htoo Zarni Oo, Teresa Mendes Maia, Kathleen Cheung, Ingrid Ehrmann, Karen E. Livermore, Hanna Zielińska, Oliver Thompson, Bridget Knight, Paul McCullagh, John McGrath, Malcolm Crundwell, Lorna W. Harries, Mads Daugaard, Simon Cockell, Nuno L. Barbosa‐Morais, Sebastian Oltean, David J. Elliott

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNIHR Exeter Clinical Research FacilityUniversity of BristolBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilTerry Fox Research InstituteProstate Cancer UKNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésProstate cancerAlternative splicingRNA splicingAndrogen receptorCancer researchBiologyAndrogenSplicing factorMetastasisGene isoformCancerEndocrinologyGeneGeneticsHormoneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prostate is the most frequent cancer in men. Prostate cancer progression is driven by androgen steroid hormones, and delayed by androgen deprivation therapy (ADT). Androgens control transcription by stimulating androgen receptor (AR) activity, yet also control pre-mRNA splicing through less clear mechanisms. Here we find androgens regulate splicing through AR-mediated transcriptional control of the epithelial-specific splicing regulator ESRP2 . Both ESRP2 and its close paralog ESRP1 are highly expressed in primary prostate cancer. Androgen stimulation induces splicing switches in many endogenous ESRP2-controlled mRNA isoforms, including a key splicing switch in the metastatic regulator FLNB which is associated with disease relapse. ESRP2 expression in clinical prostate cancer is repressed by ADT, which may thus inadvertently dampen epithelial splice programmes. Supporting this, FLNB splicing was reciprocally switched by the AR antagonist bicalutamide (Casodex ® ). Our data reveal a new mechanism of splicing control in prostate cancer with important implications for metastatic disease progression. Key points Transcriptional regulation of ESRP2 by the androgen receptor controls splice isoform patterns in prostate cancer cells. Splicing switches regulated by the androgen-ESRP2 axis include a splice isoform in the FLNB gene that is a known metastatic driver. Both ESRP1 and ESRP2 are highly expressed in prostate cancer tissue. Ectopic expression of ESRP1 and 2 inhibits prostate cancer cell growth. By repressing ESRP2 expression androgen deprivation therapy (ADT) may dampen epithelial splicing programmes to inadvertently prime disease progression towards metastasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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