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Enregistrement W2943930278 · doi:10.1016/j.nicl.2019.101856

Joint pattern analysis applied to PET DAT and VMAT2 imaging reveals new insights into Parkinson's disease induced presynaptic alterations

2019· article· en· W2943930278 sur OpenAlexafffund
Jessie Fanglu Fu, Ivan S. Klyuzhin, Jessamyn McKenzie, Nicole Neilson, Elham Shahinfard, Katie Dinelle, Martin J. McKeown, A. Jon Stoessl, Vesna Sossi

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensVancouver Coastal HealthUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTRIUMFCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsHealth ResearchMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésPutamenStriatumDopaminergicParkinson's diseaseNeuroscienceDopaminePsychologyDiseaseMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most neurodegenerative diseases are known to affect several aspects of brain function, including neurotransmitter systems, metabolic and functional connectivity. Diseases are generally characterized by common clinical characteristics across subjects, but there are also significant inter-subject variations. It is thus reasonable to expect that in terms of brain function, such clinical behaviors will be related to a general overall multi-system pattern of disease-induced alterations and additional brain system-specific abnormalities; these additional abnormalities would be indicative of a possible unique system response to disease or subject-specific propensity to a specific clinical progression. Based on the above considerations we introduce and validate the use of a joint pattern analysis approach, canonical correlation analysis and orthogonal signal correction, to analyze multi-tracer PET data to identify common (reflecting functional similarities) and unique (reflecting functional differences) information provided by each tracer/target. We apply the method to [11C]-DTBZ (VMAT2 marker) and [11C]-MP (DAT marker) data from 15 early Parkinson's disease (PD) subjects; the behavior of these two tracers/targets is well characterized providing robust reference information for the method's outcome. Highly significant common subject profiles were identified that decomposed the characteristic dopaminergic changes into three distinct orthogonal spatial patterns: 1) disease-induced asymmetry between the less and more affected dorsal striatum; 2) disease-induced gradient with caudate and ventral striatum being relatively spared compared to putamen; 3) progressive loss in the less affected striatum, which correlated significantly with disease duration (p < 0.01 for DTBZ, p < 0.05 for MP). These common spatial patterns reproduce all known aspects of these two targets/tracers. In addition, orthogonality of the patterns may indicate different mechanisms underlying disease initiation or progression. Information unique to each tracer revealed a residual striatal asymmetry when targeting VMAT2, consistent with the notion that VMAT2 density is highly related to terminal degeneration; and a residual DAT disease-induced gradient in the striatum with relative DAT preservation in the substantia nigra. This finding may be indicative either of a possible DAT specific early disease compensation and/or related to disease origin. These results demonstrate the applicability and relevance of the joint pattern analysis approach to datasets obtained with two PET tracers; this data driven method, while recapitulating known aspects of the PD-induced tracer/target behaviour, was found to be statistically more robust and provided additional information on (i) correlated behaviors of the two systems, identified as orthogonal patterns, possibly reflecting different disease-induced alterations and (ii) system specific effects of disease. It is thus expected that this approach will be very well suited to the analysis of multi-tracer and/or multi-modality data and to relating the outcomes to different aspects of disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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