An open source database for the synthesis of soil radiocarbondata: ISRaD version 1.0
Notice bibliographique
Résumé
Abstract. Radiocarbon is a critical constraint on our estimates of the timescales of soil carbon cycling that can aid in identifying mechanisms of carbon stabilization and destabilization, and improve forecast of soil carbon response to management or environmental change. Despite the wealth of soil radiocarbon data that has been reported over the past 75 years, the ability to apply these data to global scale questions is limited by our capacity to synthesis and compare measurements generated using a variety of methods. Here we describe the International Soil Radiocarbon Database (ISRaD, soilradiocarbon.org), an open-source archive of soils data that include data from bulk soils, or whole-soils; distinct soil carbon pools isolated in the laboratory by a variety of soil fractionation methods; samples of soil gas or water collected interstitially from within an intact soil profile; CO2 gas isolated from laboratory soil incubations; and fluxes collected in situ from a soil surface. The core of ISRaD is a relational database structured around individual datasets (entries) and organized hierarchically to report soil radiocarbon data, measured at different physical and temporal scales, as well as other soil or environmental properties that may also be measured at one or more levels of the hierarchy that may assist with interpretation and context. Anyone may contribute their own data to the database by entering it into the ISRaD template and subjecting it to quality assurance protocols. ISRaD can be accessed through: (1) a web-based interface, (2) an R package (ISRaD), or (3) direct access to code and data through the GitHub repository, which hosts both code and data. The design of ISRaD allows for participants to become directly involved in the management, design, and application of ISRaD data. The synthesized dataset is available in two forms: the original data as reported by the authors of the datasets; and an enhanced dataset that includes ancillary geospatial data calculated within the ISRaD framework. ISRaD also provides data management tools in the ISRaD-R package that provide a starting point for data analysis. This community-based dataset and platform for soil radiocarbon and a wide array of additional soils data information in soils where data are easy to contribute and the community is invited to add tools and ideas for improvement. As a whole, ISRaD provides resources that can aid our evaluation of soil dynamics and improve our understanding of controls on soil carbon dynamics across a range of spatial and temporal scales. The ISRaD v1.0 dataset (Lawrence et al., 2019) is archived and freely available at https://doi.org/10.5281/zenodo.2613911.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,017 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,006 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,141 | 0,157 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».