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Enregistrement W2943952861 · doi:10.3390/ijms20092356

Transcriptomic Analysis Reveals a Comprehensive Calcium- and Phytohormone-Dominated Signaling Response in Leymus chinensis Self-Incompatibility

2019· article· en· W2943952861 sur OpenAlexfundno aff
Shuangyan Chen, Junting Jia, Liqin Cheng, Pincang Zhao, Dongmei Qi, Weiguang Yang, Hui Liu, Xiaobing Dong, Xiaoxia Li, Gongshe Liu

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNational Key Research and Development Program of ChinaScience and Technology Major Project of Inner MongoliaChinese Academy of Sciences
Mots-clésTranscriptomeBiologyPollen tubePollinationGerminationCell biologyBotanyPollenCalciumLeymusGeneBiochemistryGene expressionChemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sheepgrass (Leymus chinensis (Trin.) Tzvel.) is an economically and ecologically important forage in the grass family. Self-incompatibility (SI) limits its seed production due to the low seed-setting rate after self-pollination. However, investigations into the molecular mechanisms of sheepgrass SI are lacking. Therefore, microscopic observation of pollen germination and pollen tube growth, as well as transcriptomic analyses of pistils after self- and cross-pollination, were performed. The results indicated that pollen tube growth was rapidly inhibited from 10 to 30 min after self-pollination and subsequently stopped but preceded normally after cross-pollination. Time course comparative transcriptomics revealed different transcriptome dynamics between self- and cross-pollination. A pool of SI-related signaling genes and pathways was generated, including genes related to calcium (Ca2+) signaling, protein phosphorylation, plant hormone, reactive oxygen species (ROS), nitric oxide (NO), cytoskeleton, and programmed cell death (PCD). A putative SI response molecular model in sheepgrass was presented. The model shows that SI may trigger a comprehensive calcium- and phytohormone-dominated signaling cascade and activate PCD, which may explain the rapid inhibition of self-pollen tube growth as observed by cytological analyses. These results provided new insight into the molecular mechanisms of sheepgrass (grass family) SI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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