MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2944004068 · doi:10.1038/s41598-019-43441-x

Identification of a novel strong promoter from the anhydrobiotic midge, Polypedilum vanderplanki, with conserved function in various insect cell lines

2019· article· en· W2944004068 sur OpenAlexaff
Yugo Miyata, Shoko Tokumoto, Yoichiro Sogame, Ruslan Deviatiiarov, Jun Okada, Richard Cornette, Oleg Gusev, Elena Shagimardanova, Minoru Sakurai, Takahiro Kikawada

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueTardigrade Biology and Ecology
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesRussian Science FoundationJapan Society for the Promotion of ScienceEuropean Commission
Mots-clésBiologyMidgeSf9Drosophila melanogasterEnhancerGeneReporter geneSpodopteraInsectCell cultureRNA interferenceSchneider 2 cellsHeterologousCell biologyGene expressionGeneticsBotanyLarva

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Larvae of the African midge Polypedilum vanderplanki (Diptera: Chironomidae) show a form of extreme desiccation tolerance known as anhydrobiosis. The cell line Pv11 was recently established from the species, and these cells can also survive under desiccated conditions, and proliferate normally after rehydration. Here we report the identification of a new promoter, 121, which has strong constitutive transcriptional activity in Pv11 cells and promotes effective expression of exogenous genes. Using a luciferase reporter assay, this strong transcriptional activity was shown to be conserved in cell lines from various insect species, including S2 (Drosophila melanogaster, Diptera), SaPe-4 (Sarcophaga peregrina, Diptera), Sf9 (Spodoptera frugiperda, Lepidoptera) and Tc81 (Tribolium castaneum, Coleoptera) cells. In conjunction with an appropriate selection maker gene, the 121 promoter was able to confer zeocin resistance on SaPe-4 cells and allowed the establishment of stable SaPe-4 cell lines expressing the fluorescent protein AcGFP1; this is the first report of heterologous gene expression in this cell line. These results show the 121 promoter to be a versatile tool for exogenous gene expression in a wide range of insect cell lines, particularly useful to those from non-model insect species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetTardigrade Biology and EcologyTravaux en français237 207