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Enregistrement W2944138788 · doi:10.1002/mgg3.707

The functional <i>ALDH2</i> polymorphism is associated with breast cancer risk: A pooled analysis from the Breast Cancer Association Consortium

2019· article· en· W2944138788 sur OpenAlexafffund
Tomotaka Ugai, Roger L. Milne, Hidemi Ito, Kristan J. Aronson, Manjeet K. Bolla, Tsun Leung Chan, Ching Wan Chan, Ji‐Yeob Choi, Don Conroy, Joe Dennis, Alison M. Dunning, Douglas F. Easton, Valérie Gaborieau, Anna González‐Neira, Mikael Hartman, Catherine S. Healey, Motoki Iwasaki, Esther M. John, Daehee Kang, Sung‐Won Kim, Ava Kwong, Artitaya Lophatananon, Kyriaki Michailidou, Nur Aishah Mohd Taib, Kenneth Muir, Sue K. Park, Paul D.P. Pharoah, Suleeporn Sangrajrang, Chen‐Yang Shen, Xiao‐Ou Shu, John J. Spinelli, Soo‐Hwang Teo, Daniel C. Tessier, Chiu‐Chen Tseng, Shoichiro Tsugane, Daniel Vincent, Anna H. Wu, Pei‐Ei Wu, Wei Zheng, Keitaro Matsuo

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics & Genomic Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlcohol Consumption and Health Effects
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreBC Cancer AgencyUniversity of British ColumbiaQueen's University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteBiomedical Research CouncilNational Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchCenter for Agroforestry, University of MissouriSeventh Framework ProgrammeNational Institutes of HealthKerry Group Kuok FoundationNational University Cancer Institute, SingaporeNational Research Foundation of KoreaKorea Health Industry Development InstituteMinisterio de Economía y CompetitividadMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Research FoundationWorld Health OrganizationWellcome TrustCancer Research UKGovernment of CanadaYayasan Sime DarbyMinistry of Education, Science and TechnologyAcademia SinicaEuropean CommissionBreast Cancer Research FoundationCanadian Cancer SocietyMinistry of Health, Labour and WelfareFondation du cancer du sein du QuébecBreast Cancer Research TrustInstitute of Biomedical Sciences, Academia SinicaMinistry of Public HealthGenome CanadaOvarian Cancer Research FundMcGill UniversityJapan Agency for Medical Research and DevelopmentGénome Québec
Mots-clésALDH2Odds ratioBreast cancerMedicineInternal medicineConfidence intervalCase-control studyGenotypeEstrogen receptorOncologyCancerGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Epidemiological studies consistently indicate that alcohol consumption is an independent risk factor for female breast cancer (BC). Although the aldehyde dehydrogenase 2 (ALDH2) polymorphism (rs671: Glu>Lys) has a strong effect on acetaldehyde metabolism, the association of rs671 with BC risk and its interaction with alcohol intake have not been fully elucidated. We conducted a pooled analysis of 14 case-control studies, with individual data on Asian ancestry women participating in the Breast Cancer Association Consortium. METHODS: We included 12,595 invasive BC cases and 12,884 controls for the analysis of rs671 and BC risk, and 2,849 invasive BC cases and 3,680 controls for the analysis of the gene-environment interaction between rs671 and alcohol intake for BC risk. The pooled odds ratios (OR) with 95% confidence intervals (CI) associated with rs671 and its interaction with alcohol intake for BC risk were estimated using logistic regression models. RESULTS: The Lys/Lys genotype of rs671 was associated with increased BC risk (OR = 1.16, 95% CI 1.03-1.30, p = 0.014). According to tumor characteristics, the Lys/Lys genotype was associated with estrogen receptor (ER)-positive BC (OR = 1.19, 95% CI 1.05-1.36, p = 0.008), progesterone receptor (PR)-positive BC (OR = 1.19, 95% CI 1.03-1.36, p = 0.015), and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-negative BC (OR = 1.25, 95% CI 1.05-1.48, p = 0.012). No evidence of a gene-environment interaction was observed between rs671 and alcohol intake (p = 0.537). CONCLUSION: This study suggests that the Lys/Lys genotype confers susceptibility to BC risk among women of Asian ancestry, particularly for ER-positive, PR-positive, and HER2-negative tumor types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,073

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,023
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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