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Enregistrement W2944193870 · doi:10.1183/13993003.02041-2018

An atypical pulmonary fibrosis is associated with co-inheritance of mutations in the calcium binding protein genes<i>S100A3</i>and<i>S100A13</i>

2019· article· en· W2944193870 sur OpenAlexaff
Eid Al Mutairy, Faiqa Imtiaz, Mohammed Khalid, S. Al Qattan, Soad Saleh, Linah Mahmoud, Maher Al‐Saif, Latifa Al‐Haj, Azizah A. Al-Enazi, Abdullah Aljebreen, Shamayel Faheem Mohammed, Abdullah F. Mobeireek, Khalid Alkattan, Muzamil Chisti, Irina G. Luzina, Mohammed Al‐Owain, Ihab Weheba, Abeer Abdelsayed, Khushnooda Ramzan, Luke J. Janssen, Walter Conca, Ayodele Alaiya, Kate S. Collison, Brian F. Meyer, Sergei P. Atamas, Khalid S.A. Khabar, Jeffrey D. Hasday, Futwan Al‐Mohanna

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcMaster UniversitySt. Joseph's Hospital
Organismes subventionnairesKing Abdulaziz City for Science and TechnologyKing Faisal Specialist Hospital and Research CentreHamad Medical Corporation
Mots-clésPulmonary fibrosisFibrosisLungPathologyMedicinePulmonary hypertensionExtracellular matrixBiologyCancer researchGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Pulmonary fibrosis is one of the leading indications for lung transplantation. The disease, which is of unknown aetiology, can be progressive, resulting in distortion of the extracellular matrix (ECM), inflammation, fibrosis and eventual death. Methods 13 patients born to consanguineous parents from two unrelated families presenting with interstitial lung disease were clinically investigated. Nine patients developed respiratory failure and subsequently died. Molecular genetic investigations were performed on patients' whole blood or archived tissues, and cell biological investigations were performed on patient-derived fibroblasts. Results The combination of a unique pattern of early-onset lung fibrosis (at 12–15 years old) with distinctive radiological findings, including 1) traction bronchiectasis, 2) intralobular septal thickening, 3) shrinkage of the secondary pulmonary lobules mainly around the bronchovascular bundles and 4) early type 2 respiratory failure (elevated blood carbon dioxide levels), represents a novel clinical subtype of familial pulmonary fibrosis. Molecular genetic investigation of families revealed a hypomorphic variant inS100A3and a novel truncating mutation inS100A13, both segregating with the disease in an autosomal recessive manner. Family members that were either heterozygous carriers or wild-type normal for both variants were unaffected. Analysis of patient-derived fibroblasts demonstrated significantly reduced S100A3 and S100A13 expression. Further analysis demonstrated aberrant intracellular calcium homeostasis, mitochondrial dysregulation and differential expression of ECM components. Conclusion Our data demonstrate that digenic inheritance of mutations inS100A3andS100A13underlie the pathophysiology of pulmonary fibrosis associated with a significant reduction of both proteins, which suggests a calcium-dependent therapeutic approach for management of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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