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Enregistrement W2944265356 · doi:10.1139/cjc-2018-0412

Surface plasmon resonance study of the interaction of 4,4′-dianilino-1,1′-binaphthyl-5,5′-disulfonic acid dipotassium salt (bis-ANS) and adenosine triphosphate (ATP) with oligomeric recombinant human lens αA-crystallin

2019· article· en· W2944265356 sur OpenAlexvenueno aff
Srabani Karmakar, Shrutidhara Biswas, Umakanta Tripathy

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrystallinChemistrySurface plasmon resonanceBiophysicsProtein subunitChaperone (clinical)RetinalBiochemistryKineticsAdenosine triphosphateStereochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

α-Crystallin, an abundant mammalian lens protein made up of two subunits (αA- and αB-crystallin), is involved in the maintenance of the optimal refractive index in the lens. The protein is implicated in the pathophysiology of a large number of retinal diseases including cataract, age-related macular degeneration, diabetic retinopathy, and uveitis. α-Crystallin belongs to the small heat shock protein (sHSP) family, forms large oligomeric structures, and functions as a molecular chaperone appearing very early during embryonic development. To gain mechanistic insight into the structural and functional role of α-crystallin and its alterations in various retinal diseases, it is important to study the interaction chemistry with its known partners. The hydrophobic sites in α-crystallin have been studied extensively using environmentally sensitive fluorescent probes such as 4,4′-dianilino-1,1′-binaphthyl-5,5′-disulfonic acid dipotassium salt (bis-ANS) that interacts with both subunits of α-cystallin in 1:1 stoichiometry at 37 °C and diminishes the chaperone-like activity of the protein. Furthermore, it has been shown that ATP plays a crucial role in the association of α-crystallin with substrate proteins. We use surface plasmon resonance (SPR) to monitor the interactions of immobilized oligomeric recombinant αA subunit of human α-crystallin protein with bis-ANS and ATP. We assess the thermodynamic parameters and kinetics of such interactions at various temperatures. Our results indicate that bis-ANS binds to αA-crystallin with higher affinity when compared with ATP, although both αA-crystallin and αB-crystallin display fast interaction kinetics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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