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Enregistrement W2944299841 · doi:10.1158/1538-7445.am10-ssy01-03

Abstract SSY01-03: An RNAi screen identifies a heme biosynthetic mediator as a novel radiosensitizing target for head and neck cancer

2010· article· en· W2944299841 sur OpenAlexaff
Emma Ito, Shi‐Jun Yue, Eduardo H. Moriyama, Angela Bik‐Yu Hui, Inki Kim, Wei Shi, Nehad M. Alajez, Nirmal Bhogal, Guohua Li, Alessandro Datti, Aaron D. Schimmer, Brian C. Wilson, Peter P. Liu, Daniel Durocher, Benjamin G. Neel, Brian O’Sullivan, Bernard Cummings, Robert G. Bristow, Fei‐Fei Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteToronto General HospitalOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRadioresistanceCancer researchCancerIn vivoMedicineHead and neck cancerCancer cellRadiosensitizerRadiation therapyDruggabilityBiologyGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Head and neck cancer (HNC) is a challenging disease due to its heterogeneity and complexity. Despite continued advances in therapeutic options, treatment-associated toxicities and overall clinical outcomes have remained disappointing. Even with radiation therapy (RT), which remains the primary curative modality for HNC, the most effective regimens achieve local control rates of 50-70%, with disease free survival rates of only 30-40% for patients with locally advanced HNSCC. Thus, the development of novel strategies to enhance tumor cell killing, while minimizing damage to the surrounding normal tissues, is critical for improving cure rates with RT. Methods: A siRNA-based high-throughput screen (HTS) was performed for the large-scale identification of novel genes that will selectively sensitize HNC cells to ionizing radiation (IR). The Dharmacon Protein Kinase and Druggable Genome siRNA Libraries were screened using FaDu cells (human hypopharyngeal squamous cell cancer). Radiosensitizing targets were subjected to functional validation studies and in vitro characterization of mechanisms for radiosensitization. In vivo validation studies including tumor formation assays and the treatment of established HNC xenograft models were also conducted. Results: The HTS identified 67 target sequences with potential radiosensitizing effects; the validity of the screen was corroborated by the identification of known radiosensitizing targets (e.g. ATM, ATR, AURKA). Targets reducing the surviving fraction by >50% at 2 Gy relative to their un-irradiated counterparts were selected for further evaluation. A key regulator of the heme biosynthetic pathway was thus identified as a novel tumor-selective radiosensitizing target. Down-regulation of the enzyme plus IR induced caspase-mediated apoptosis and cell cycle arrest in vitro, while delaying tumor growth in vivo. Radiosensitization appeared to be mediated via enhancement of tumor oxidative stress from perturbation of iron homeostasis and increased reactive oxygen species production. This radiosensitizing target was significantly over-expressed in HNC patient biopsies, wherein lower pre-RT mRNA levels correlated with improved survival, suggesting that this enzyme could also be a potential predictor for radiation response. Down-regulation of the enzyme also radiosensitized several different human cancer models, while sparing normal cells. Conclusion: We have successfully developed an RNAi-based radiosensitizer HTS, and uncovered a key regulator of heme biosynthesis as a potent sensitizer for RT, with potentially broad implications in the management of many human malignancies. Citation Format: Emma Ito, Shijun Yue, Eduardo H. Moriyama, Angela B. Hui, Inki Kim, Wei Shi, Nehad M. Alajez, Nirmal Bhogal, GuoHua Li, Alessandro Datti, Aaron D. Schimmer, Brian C. Wilson, Peter P. Liu, Daniel Durocher, Benjamin G. Neel, Brian O'Sullivan, Bernard Cummings, Rob Bristow, Fei-Fei Liu. An RNAi screen identifies a heme biosynthetic mediator as a novel radiosensitizing target for head and neck cancer [abstract]. In: Proceedings of the AACR 101st Annual Meeting 2010; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr SSY01-03

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,831

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
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