Genome‐wide survey of copy number variants finds MAPT duplications in progressive supranuclear palsy
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Progressive supranuclear palsy is a neurodegenerative tauopathy manifesting clinically as a progressive akinetic‐rigid syndrome. In this study, we sought to identify genetic variants influencing PSP susceptibility through a genome‐wide association analysis of a cohort of well‐characterized patients who had participated in the Neuroprotection and Natural History in Parkinson Plus Syndromes and Blood Brain Barrier in Parkinson Plus Syndromes studies. Methods We genotyped single‐nucleotide polymorphisms in 283 PSP cases from the United Kingdom, Germany, and France and compared these with genotypes from 4472 controls. Copy number variants were identified from genotyping data. Results We observed associations on chromosome 17 within or close to the MAPT gene and explored the genetic architecture at this locus. We confirmed the previously reported association of rs1768208 in the MOBP gene ( P = 3.29 × 10 ‐13 ) and rs1411478 in STX6 ( P = 3.45 × 10 ‐10 ). The population‐attributable risk from the MAPT , MOBP , and STX6 single‐nucleotide polymorphisms was found to be 0.37, 0.26, and 0.08, respectively. In addition, we found 2 instances of copy number variants spanning the MAPT gene in patients with PSP. These copy number variants include tau but few other genes within the chromosome 17 haplotype region, providing additional support for the direct pathogenicity of MAPT in PSP. Conclusions Clinicians should also be aware of MAPT duplication as a possible genetic cause of PSP, especially in patients presenting with young age at onset. © 2019 International Parkinson and Movement Disorder Society
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».