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Enregistrement W2944554701 · doi:10.1080/15476286.2019.1608754

Gld2 activity is regulated by phosphorylation in the N-terminal domain

2019· article· en· W2944554701 sur OpenAlexafffund
Christina Z. Chung, Nileeka Balasuriya, Emad Manni, Xuguang Liu, Shawn S.‐C. Li, Patrick O’Donoghue, Ilka U. Heinemann

Notice bibliographique

RevueRNA Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsCanada Foundation for Innovation
Mots-clésPhosphorylationBiologyKinaseHEK 293 cellsmicroRNAProtein kinase domainCell biologyPhosphorylation cascadeProtein phosphorylationProtein kinase ABiochemistryMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The de-regulation of microRNAs (miRNAs) is associated with multiple human diseases, yet cellular mechanisms governing miRNA abundance remain largely elusive. Human miR-122 is required for Hepatitis C proliferation, and low miR-122 abundance is associated with hepatic cancer. The adenylyltransferase Gld2 catalyses the post-transcriptional addition of a single adenine residue (A + 1) to the 3'-end of miR-122, enhancing its stability. Gld2 activity is inhibited by binding to the Hepatitis C virus core protein during HepC infection, but no other mechanisms of Gld2 regulation are known. We found that Gld2 activity is regulated by site-specific phosphorylation in its disordered N-terminal domain. We identified two phosphorylation sites (S62, S110) where phosphomimetic substitutions increased Gld2 activity and one site (S116) that markedly reduced activity. Using mass spectrometry, we confirmed that HEK 293 cells readily phosphorylate the N-terminus of Gld2. We identified protein kinase A (PKA) and protein kinase B (Akt1) as the kinases that site-specifically phosphorylate Gld2 at S116, abolishing Gld2-mediated nucleotide addition. The data demonstrate a novel phosphorylation-dependent mechanism to regulate Gld2 activity, revealing tumour suppressor miRNAs as a previously unknown target of Akt1-dependent signalling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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