SUN-475 Analysis of Palmitate- and Bisphenol A-Mediated Changes in MicroRNAs Targeting the Novel Reproductive Peptide Phoenixin and Its Receptor Gpr173 in Hypothalamic Cell Lines
Notice bibliographique
Résumé
Phoenixin (PNX) is a recently identified peptide that forms part of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis. It is a highly conserved, 14 or 20 amino acid peptide expressed at high levels in the hypothalamus. Within hypothalamic neurons, PNX increases gene expression of gonadotropin-releasing hormone (GnRH) and kisspeptin, two critical reproductive peptides. In relation to reproductive function, knockdown of either PNX or its receptor, GPR173, extends the estrous cycle. As PNX and GPR173 are relatively understudied, delineating how this peptide and its putative receptor are regulated at the gene level is essential for further definition of functional significance. We have previously reported that palmitate, a saturated fatty acid, increases Pnx and reduces Gpr173 mRNA levels over 24 hours in immortalized hypothalamic clonal cell lines. We have also found that bisphenol A (BPA), an endocrine disrupting chemical widely thought to inhibit reproductive function, reduces Pnx and Gpr173 gene expression. The mechanism by which these compounds alter gene expression is the subject of current investigation. One layer of gene regulation is microRNAs (miRNAs), short segments of RNA that decrease mRNA expression levels. Palmitate and BPA are known to alter microRNA (miRNA) levels in tissues outside of the hypothalamus; therefore, we hypothesized that levels of miRNAs that target Pnx and Gpr173 in the hypothalamus may be contributing to the observed palmitate- and BPA-mediated changes in mRNA levels. Using the predictive online resources, miRwalk 3.0, TargetScan and miRanda, we have identified 112 miRNAs with putative binding sites in the Pnx 3’UTR, as well as 300 miRNAs that can bind the Gpr173 3’UTR. To identify miRNAs affected by palmitate or BPA exposure, the mHypoE-46 and the mHypoA-59 cell lines were treated with 50 μM palmitate or 100 μM BPA, respectively, for 4 and 24 hours. The miRNA profiles after these treatments are being assessed on the Affymetrix GeneChip miRNA 4.0 array, which includes over 30,000 probe sets for mature miRNAs. Whether the miRNAs mediate the alterations in Pnx and Gpr173 gene expression will be assessed through the use of antagomirs and mimics. Knowledge of miRNAs controlling Pnx and Gpr173 expression contributes to our understanding of how nutrients and environmental chemicals affect the hypothalamus, potentially representing new targets for therapeutics.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».