MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2944593642 · doi:10.1210/js.2019-sun-475

SUN-475 Analysis of Palmitate- and Bisphenol A-Mediated Changes in MicroRNAs Targeting the Novel Reproductive Peptide Phoenixin and Its Receptor Gpr173 in Hypothalamic Cell Lines

2019· article· en· W2944593642 sur OpenAlexaff
Emma K. McIlwraith, Denise D. Belsham

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHypothalamic control of reproductive hormones
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGene knockdownmicroRNAInternal medicineEndocrinologyKisspeptinGonadotropin-releasing hormoneMessenger RNAHypothalamusGene expressionReceptorGeneHormoneGeneticsLuteinizing hormoneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phoenixin (PNX) is a recently identified peptide that forms part of the hypothalamic-pituitary-gonadal axis. It is a highly conserved, 14 or 20 amino acid peptide expressed at high levels in the hypothalamus. Within hypothalamic neurons, PNX increases gene expression of gonadotropin-releasing hormone (GnRH) and kisspeptin, two critical reproductive peptides. In relation to reproductive function, knockdown of either PNX or its receptor, GPR173, extends the estrous cycle. As PNX and GPR173 are relatively understudied, delineating how this peptide and its putative receptor are regulated at the gene level is essential for further definition of functional significance. We have previously reported that palmitate, a saturated fatty acid, increases Pnx and reduces Gpr173 mRNA levels over 24 hours in immortalized hypothalamic clonal cell lines. We have also found that bisphenol A (BPA), an endocrine disrupting chemical widely thought to inhibit reproductive function, reduces Pnx and Gpr173 gene expression. The mechanism by which these compounds alter gene expression is the subject of current investigation. One layer of gene regulation is microRNAs (miRNAs), short segments of RNA that decrease mRNA expression levels. Palmitate and BPA are known to alter microRNA (miRNA) levels in tissues outside of the hypothalamus; therefore, we hypothesized that levels of miRNAs that target Pnx and Gpr173 in the hypothalamus may be contributing to the observed palmitate- and BPA-mediated changes in mRNA levels. Using the predictive online resources, miRwalk 3.0, TargetScan and miRanda, we have identified 112 miRNAs with putative binding sites in the Pnx 3’UTR, as well as 300 miRNAs that can bind the Gpr173 3’UTR. To identify miRNAs affected by palmitate or BPA exposure, the mHypoE-46 and the mHypoA-59 cell lines were treated with 50 μM palmitate or 100 μM BPA, respectively, for 4 and 24 hours. The miRNA profiles after these treatments are being assessed on the Affymetrix GeneChip miRNA 4.0 array, which includes over 30,000 probe sets for mature miRNAs. Whether the miRNAs mediate the alterations in Pnx and Gpr173 gene expression will be assessed through the use of antagomirs and mimics. Knowledge of miRNAs controlling Pnx and Gpr173 expression contributes to our understanding of how nutrients and environmental chemicals affect the hypothalamus, potentially representing new targets for therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,546
Score d'incertitude au seuil0,609

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Endocrine SocietyMême sujetHypothalamic control of reproductive hormonesTravaux en français237 207