OsbZIP81, A Homologue of Arabidopsis VIP1, May Positively Regulate JA Levels by Directly Targetting the Genes in JA Signaling and Metabolism Pathway in Rice
Notice bibliographique
Résumé
Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important food crops in the world. In plants, jasmonic acid (JA) plays essential roles in response to biotic and abiotic stresses. As one of the largest transcription factors (TFs), basic region/leucine zipper motif (bZIP) TFs play pivotal roles through the whole life of plant growth. However, the relationship between JA and bZIP TFs were rarely reported, especially in rice. In this study, we found two rice homologues of Arabidopsis VIP1 (VirE2-interacting protein 1), OsbZIP81, and OsbZIP84. OsbZIP81 has at least two alternative transcripts, OsbZIP81.1 and OsbZIP81.2. OsbZIP81.1 and OsbZIP84 are typical bZIP TFs, while OsbZIP81.2 is not. OsbZIP81.1 can directly bind OsPIOX and activate its expression. In OsbZIP81.1 overexpression transgenic rice plant, JA (Jasmonic Acid) and SA (Salicylic acid) were up-regulated, while ABA (Abscisic acid) was down-regulated. Moreover, Agrobacterium, Methyl Jasmonic Acid (MeJA), and PEG6000 can largely induce OsbZIP81. Based on ChIP-Seq and Random DNA Binding Selection Assay (RDSA), we identified a novel cis-element OVRE (Oryza VIP1 response element). Combining ChIP-Seq and RNA-Seq, we obtained 1332 targeted genes that were categorized in biotic and abiotic responses, including α-linolenic acid metabolism and fatty acid degradation. Together, these results suggest that OsbZIP81 may positively regulate JA levels by directly targeting the genes in JA signaling and metabolism pathway in rice.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».