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Enregistrement W2944647529 · doi:10.1093/jnen/nlz026

Distinct Function-Related Molecular Profile of Adult Human A2B5-Positive Pre-Oligodendrocytes Versus Mature Oligodendrocytes

2019· article· en· W2944647529 sur OpenAlexaff
Caroline Esmonde-White, Moein Yaqubi, Philippe‐Antoine Bilodeau, Qiao Ling Cui, Florian Pernin, Catherine Larochelle, Mahtab Ghadiri, Yu Kang T. Xu, Timothy E. Kennedy, Jeffery A. Hall, Luke M. Healy, Jack P. Antel

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuropathology & Experimental Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMultiple Sclerosis Society
Mots-clésRemyelinationBiologyProgenitor cellCell biologyOligodendrocyteDownregulation and upregulationPopulationStem cellMyelinImmunologyGeneGeneticsNeuroscienceCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Remyelination in the human CNS is ascribed to progenitor cells rather than previously myelinating oligodendrocytes (OLs). The ganglioside-recognizing antibody A2B5 has been used to isolate putative progenitor cells, whose in vitro features resemble cells labeled as "pre-oligodendrocytes." Here, we compare the transcriptional profiles of adult human brain-derived A2B5 antibody-selected cells (A+) after initial isolation (day in vitro (DIV1)) and after DIV6, with nonselected (A-) cells (mature OLs), with regard to their differentiation state and functional properties. While a number of previously recognized progenitor associated genes, specifically PTPRZ1 and PDGFRα, were upregulated in the A2B5+ population, a number of such genes were comparably expressed in the mature OLs, as were mature myelin genes. Additional progenitor-related genes were upregulated in the A+ population. We show that A2B5+ cells have greater capacity to ensheath nanofibers, a model of myelination potential; consistent with this, ingenuity pathway analysis indicated that A+ cells had upregulated expression of genes within cell growth and cell signaling pathways. Differential expression of cell death/survival pathways complements previous functional studies showing their increased susceptibility to metabolic stress. At DIV6, we observed significantly fewer differentially expressed genes; suggestive of cell maturation occurring in vitro, indicating the complexity in comparing in vitro and in situ cell properties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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