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Enregistrement W2944767973 · doi:10.1089/gtmb.2018.0329

HLA-DQ Typing Kits in Diagnosis and Screening for Celiac Disease

2019· article· en· W2944767973 sur OpenAlex
Maxine D. Rouvroye, Sander van Zijtveld, Petra Bonnet, Eric Spierings, Hetty J. Bontkes

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetic Testing and Molecular Biomarkers · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésHuman leukocyte antigenTypingMultiplexMedicineDiseaseImmunologyBioinformaticsInternal medicineAntigenBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aim: Celiac disease (CD) is strongly associated with HLA-DQ2.2, HLA-DQ2.5, and HLA-DQ8. Up to 99.7% of all CD patients are positive for either one or two of these genetic markers, demonstrating a high negative predictive value. This has led to the development of diagnostic kits that, instead of providing a full HLA-DQ typing, detect only these three HLA-DQ types. Our aim was to compare three different kits for their performance, utilization, and costs. Because 0.4-3.6% of all CD patients test positive for HLA-DQ7 and negative for the aforementioned types, information provided by the kits regarding DQ7 alpha and beta chains was evaluated as well. Materials and Methods: Fifty DNA samples previously typed with the SSCP method were analyzed using three commercial kits. Results and Discussion: All kits report hetero- or homozygosity for HLA-DQ2.5. The XeliGen kit directly detects HLA-DQ7, but is relatively expensive. The MLPA kit is the least expensive in terms of reagents and may indirectly detect HLA-DQ7. The CeliaSCAN kit is easy to use and provides indirect information about HLA-DQ7.5. Conclusion: All kits correctly identify the CD risk genes. The resources of the laboratory and the intended use should determine the preference for any of the HLA-DQ typing kits herein described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,295
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle