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Enregistrement W2944775438 · doi:10.1002/mp.13581

Deep learning‐based carotid media‐adventitia and lumen‐intima boundary segmentation from three‐dimensional ultrasound images

2019· article· en· W2944775438 sur OpenAlexaff
Ran Zhou, Aaron Fenster, Yujiao Xia, J. David Spence, Mingyue Ding

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Health and Disease Prevention
Établissements canadiensThrombosis and Atherosclerosis Research InstituteRobarts Clinical TrialsWestern University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSegmentationArtificial intelligenceComputer scienceComputer visionPixelImage segmentationConvolutional neural networkPattern recognition (psychology)UltrasoundRadiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Quantification of carotid plaques has been shown to be important for assessing as well as monitoring the progression and regression of carotid atherosclerosis. Various metrics have been proposed and methods of measurements ranging from manual tracing to automated segmentations have also been investigated. Of those metrics, quantification of carotid plaques by measuring vessel-wall-volume (VWV) using the segmented media-adventitia (MAB) and lumen-intima (LIB) boundaries has been shown to be sensitive to temporal changes in carotid plaque burden. Thus, semi-automatic MAB and LIB segmentation methods are required to help generate VWV measurements with high accuracy and less user interaction. METHODS: In this paper, we propose a semiautomatic segmentation method based on deep learning to segment the MAB and LIB from carotid three-dimensional ultrasound (3DUS) images. For the MAB segmentation, we convert the segmentation problem to a pixel-by-pixel classification problem. A dynamic convolutional neural network (Dynamic CNN) is proposed to classify the patches generated by sliding a window along the norm line of the initial contour where the CNN model is fine-tuned dynamically in each test task. The LIB is segmented by applying a region-of-interest of carotid images to a U-Net model, which allows the network to be trained end-to-end for pixel-wise classification. RESULTS: A total of 144 3DUS images were used in this development, and a threefold cross-validation technique was used for evaluation of the proposed algorithm. The proposed algorithm-generated accuracy was significantly higher than the previous methods but with less user interactions. Comparing the algorithm segmentation results with manual segmentations by an expert showed that the average Dice similarity coefficients (DSC) were 96.46 ± 2.22% and 92.84 ± 4.46% for the MAB and LIB, respectively, while only an average of 34 s (vs 1.13, 2.8 and 4.4 min in previous methods) was required to segment a 3DUS image. The interobserver experiment indicated that the DSC was 96.14 ± 1.87% between algorithm-generated MAB contours of two observers' initialization. CONCLUSIONS: Our results showed that the proposed carotid plaque segmentation method obtains high accuracy and repeatability with less user interactions, suggesting that the method could be used in clinical practice to measure VWV and monitor the progression and regression of carotid plaques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,149
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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