Molecular Phylogenetic Relationships, Trichothecene Chemotype Diversity and Aggressiveness of Strains in a Global Collection of Fusarium graminearum Species
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium head blight (FHB), caused principally by the species belonging to the Fusarium graminearum species complex (FGSC), is an important disease in wheat, barley, and other small grain crops worldwide. Grain infected with species in the FGSC may be contaminated with trichothecene mycotoxins such as deoxynivalenol (DON) and nivalenol (NIV). In this study, we characterized the phylogenetic relationships, chemotype diversity, phenotypic characters, and aggressiveness of 150 strains in FGSC collected from eight different countries. Phylogenetic analysis based on portions of translation elongation factor 1-α (EF-1α) gene from 150 strains revealed six species in the FGSC, F. graminearum s.s, F. asiaticum, F. meridionale, F. cortaderiae, F. boothii, and F. austroamericanum. In this collection, 50% of the strains were 15-acetyldeoxynivalenol (15-ADON), 35% were 3-acetyldeoxynivalenol (3-ADON) and 15% were NIV. Evaluation of strains on moderately resistant (MR) wheat cultivar Carberry indicated that there is no significant difference among the species for FHB disease severity (DS), fusarium damaged kernel percentage (FDK%) and DON production. However, significant differences were observed among the chemotypes. Results showed significantly higher FHB DS, FDK%, DON production, growth rates, and macroconidia production for the 3-ADON strains than the 15-ADON and NIV strains. In addition, significant differences for FHB response variables were observed among the strains from different countries. Our results demonstrate that type and amount of trichothecene produced by a strain play a key role in determining the level of aggressiveness of that particular strain, regardless of the species.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».