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Enregistrement W2944967705 · doi:10.1097/pai.0000000000000773

Chromogenic and Silver in Situ Hybridization for Identification of HER 2 Overexpression in Breast Cancer Patients: A Systematic Review and Meta-Analysis

2019· review· en· W2944967705 sur OpenAlexaff
Luiza R. Grazziotin, Bukky R. Dada, Carolina de la Rosa Jaimes, Winson Y. Cheung, Deborah A. Marshall

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCISHChromogenic in situ hybridizationConfidence intervalMedicineMeta-analysisConcordanceOncologyBreast cancerInternal medicineCancerIn situ hybridizationBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: This systematic review has the purpose to characterize the accuracy of chromogenic in situ hybridization (CISH) and silver in situ hybridization (SISH), in comparison to fluorescence in situ hybridization (FISH) in the identification of human epidermal growth factor receptor-2 (HER2) overexpression and to inform decisions about test selection. MATERIALS AND METHODS: We searched MEDLINE and EMBASE databases using these eligibility criteria: studies evaluating invasive breast cancer samples which examined agreement between CISH or SISH, and FISH, and reported sensitivity, specificity, or concordance. We performed a bivariate meta-analysis of sensitivity and specificity using a generalized linear mixed model. We used likelihood ratio tests from meta-regression to compare accuracy between HER2 tests. RESULTS: The search identified 4475 articles, of which 32 were included. The summary estimates for sensitivity and specificity were 0.91 [95% confidence interval (CI), 0.85-0.95], and 0.97 (95% CI, 0.93-0.99) for SISH; 0.97 (95% CI, 0.83-1.00) and 0.99 (95% CI, 0.96-1.00) for single-probe CISH; and, 0.98 (95% CI, 0.92-0.99) and 0.98 (95% CI, 0.91-0.99) for dual-probe CISH. Significantly higher sensitivity was reported for dual-CISH than SISH (χ: 5.36; P=0.02) when compared with the reference test FISH. CONCLUSIONS: The agreement between new bright field tests (SISH and CISH) and FISH is high (≥92%). Indirect comparison of HER2 tests indicated that overall CISH performance exceeds that of SISH. The pooled estimates from this meta-analysis summarize the current published literature and, in addition to other factors such as costs differentials, can help inform future HER2 test selection decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,879
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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