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Enregistrement W2945124933 · doi:10.1111/nph.15911

A role for <i><scp>SPEECHLESS</scp></i> in the integration of leaf stomatal patterning with the growth vs disease trade‐off in poplar

2019· article· en· W2945124933 sur OpenAlexafffund
Athena D. McKown, Jaroslav Klápště, Robert D. Guy, Oliver R.A. Corea, Steffi Fritsche, Jürgen Ehlting, Yousry A. El‐Kassaby, Shawn D. Mansfield

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of VictoriaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreGenome Canada
Mots-clésCell biologyPlant growthBiologyBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Occurrence of stomata on both leaf surfaces (amphistomaty) promotes higher stomatal conductance and photosynthesis while simultaneously increasing exposure to potential disease agents in black cottonwood (Populus trichocarpa). A genome-wide association study (GWAS) with 2.2M single nucleotide polymorphisms generated through whole-genome sequencing found 280 loci associated with variation in adaxial stomatal traits, implicating genes regulating stomatal development and behavior. Strikingly, numerous loci regulating plant growth and response to biotic and abiotic stresses were also identified. The most significant locus was a poplar homologue of SPEECHLESS (PtSPCH1). Individuals possessing PtSPCH1 alleles associated with greater adaxial stomatal density originated primarily from environments with shorter growing seasons (e.g. northern latitudes, high elevations) or with less precipitation. PtSPCH1 was expressed in developing leaves but not developing stem xylem. In developing leaves, RNA sequencing showed patterns of coordinated expression between PtSPCH1 and other GWAS-identified genes. The breadth of our GWAS results suggests that the evolution of amphistomaty is part of a larger, complex response in plants. Suites of genes underpin this response, retrieved through genetic association to adaxial stomata, and show coordinated expression during development. We propose that the occurrence of amphistomaty in P. trichocarpa involves PtSPCH1 and reflects selection for supporting rapid growth over investment in immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,637
Score d'incertitude au seuil0,742

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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