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Enregistrement W2945331960 · doi:10.3389/fmicb.2019.01038

A Novel Mathematical Model for Studying Antimicrobial Interactions Against Campylobacter jejuni

2019· article· en· W2945331960 sur OpenAlexafffund
Mohammed J. Hakeem, Khalid A. Asseri, Luyao Ma, Keng C. Chou, Michael E. Konkel, Xiaonan Lu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKing Saud University
Mots-clésCampylobacter jejuniAntimicrobialCampylobacterBiologyMicrobiologyComputational biologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study is to investigate the antimicrobial synergistic effect against Campylobacter jejuni, a leading foodborne pathogen that causes human gastroenteritis, by cinnamon oil, encapsulated curcumin, and zinc oxide nanoparticles (ZnO NPs). We compared three approaches to study the antimicrobial interactions, including the time-killing method, the fractional inhibitory concentration index (FICI) method, and a mathematical concentration-effect model. Isobologram analysis was performed to evaluate the synergy in different combinations, and a median-effect equation was applied to identify the combinations of synergistic effects at median, bacteriostatic, and bactericidal reduction levels. The time-killing method overestimated the synergistic interaction between antimicrobials, while the FICI method failed to detect an existing synergistic phenomenon. This lack of accuracy and sensitivity was mainly due to combining antimicrobials without a deep understanding of their concentration-effect relationships. Our results showed that each antimicrobial had a unique concentration-effect curve. Specifically, encapsulated curcumin showed a sharp sigmoidal curve unlike cinnamon oil and zinc oxide nanoparticles. A mathematical model was applied to study the interaction between antimicrobials with a different shape of concentration-effect curve. We observed an additive effect of cinnamon oil/ZnO NPs and synergistic interactions of other binary combinations (cinnamon oil/encapsulated curcumin and ZnO NPs/encapsulated curcumin). The tertiary combination of cinnamon oil/ZnO NPs/encapsulated curcumin at IC25 (additive line <1-log CFU/mL) presented the greatest synergistic effect by reducing the bacterial population over 8-log CFU/mL. This mathematical model provided an alternative strategy to develop a new antimicrobial strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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