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Enregistrement W2945346908 · doi:10.1136/gutjnl-2019-318556

International Cancer Microbiome Consortium consensus statement on the role of the human microbiome in carcinogenesis

2019· article· en· W2945346908 sur OpenAlexaff
Alasdair Scott, James L. Alexander, Claire A Merrifield, David Cunningham, Christian Jobin, Robert Brown, John C. Alverdy, Stephen J. O’Keefe, H. Rex Gaskins, Julian Teare, Jun Yu, David J. Hughes, Hans Verstraelen, Jeremy P. Burton, Paul W. O’Toole, Julian R. Marchesi

Notice bibliographique

RevueGut · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchImperial College Healthcare NHS TrustImperial College LondonNational Cancer InstituteNIHR Imperial Biomedical Research CentreCancer Research UK
Mots-clésMicrobiomeStatement (logic)CarcinogenesisCancerBiologyHuman Microbiome ProjectBioinformaticsHuman microbiomeComputational biologyMedicineGeneticsPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: In this consensus statement, an international panel of experts deliver their opinions on key questions regarding the contribution of the human microbiome to carcinogenesis. DESIGN: International experts in oncology and/or microbiome research were approached by personal communication to form a panel. A structured, iterative, methodology based around a 1-day roundtable discussion was employed to derive expert consensus on key questions in microbiome-oncology research. RESULTS: Some 18 experts convened for the roundtable discussion and five key questions were identified regarding: (1) the relevance of dysbiosis/an altered gut microbiome to carcinogenesis; (2) potential mechanisms of microbiota-induced carcinogenesis; (3) conceptual frameworks describing how the human microbiome may drive carcinogenesis; (4) causation versus association; and (5) future directions for research in the field.The panel considered that, despite mechanistic and supporting evidence from animal and human studies, there is currently no direct evidence that the human commensal microbiome is a key determinant in the aetiopathogenesis of cancer. The panel cited the lack of large longitudinal, cohort studies as a principal deciding factor and agreed that this should be a future research priority. However, while acknowledging gaps in the evidence, expert opinion was that the microbiome, alongside environmental factors and an epigenetically/genetically vulnerable host, represents one apex of a tripartite, multidirectional interactome that drives carcinogenesis. CONCLUSION: Data from longitudinal cohort studies are needed to confirm the role of the human microbiome as a key driver in the aetiopathogenesis of cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,137
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,131
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,137
Score d'incertitude au seuil0,722

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1370,131
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0090,011
Intégrité de la recherche0,0180,023
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations275
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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