Prognostic Value of MMP-9 -1562 C/T Gene Polymorphism in Patients With Sepsis
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) plays an important role in the pathophysiology of sepsis. A single-nucleotide polymorphism (SNP) at position -1562 (C/T) in the MMP-9 gene has been associated with differential MMP-9 expression, being higher when the -1562 T allele is present. We evaluated the association of the SNP MMP9 -1562 C/T with severity and mortality in patients with sepsis to establish whether the prognosis of the disease is affected. Materials and Methods: A case-control study exploratory was carried out in a cohort of infected patients. 540 individuals were selected in total, 270 patients with sepsis and 270 controls (infected but non-septic), classified according to the 2016 consensus (Sepsis-3). The presence of the single-nucleotide polymorphism (SNP; allele T and/or allele C) was determined through analyses of restriction fragment length polymorphism and plasma levels of MMP-9 were determined through enzyme-linked immunosorbent assay immunoassay. Results: SNP MMP-9 -1562 has two known alleles (T and C), with predominance of the C over the T allele; in the group of patients with sepsis, T allele was found in 7.2% of cases, while C allele in the rest (92.8%); in comparison, in the group of infected but non-septic patients, frequencies were 9.4% for T allele and 90.6% for the C allele ( P = .33). Also, the presence of the polymorphic T allele was not related to the levels of MMP-9 in patients with sepsis in comparison with infected but non-septic patients 780 (397-1375) ng/mL vs 646 (172-1249) ng/mL ( P = .64). There was also no association between the SNP and sepsis mortality ( P = .78). Conclusions: We concluded that there was no association between the SNP MMP9 -1562 C/T and sepsis or between the SNP MMP9 -1562 C/T and sepsis mortality in the Northeastern Colombian septic patient cohort. Further research is needed to clarify the correlation among sepsis, genetic factors with allele T and MMP-9 plasma concentration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».