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Enregistrement W2945576786 · doi:10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.545.1

The Evolution of Air‐breathing Revised

2019· article· en· W2945576786 sur OpenAlexaff
Christian Damsgaard, Vikram B. Baliga

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish biology, ecology, and behavior
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCarlsbergfondet
Mots-clésExtant taxonBreathingBreathing gasEvolutionary biologyCladeBiologyVentilation (architecture)PhylogeneticsAnatomyMeteorologyGeographyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The evolution of air‐breathing represents one the most pronounced changes in the cardio‐respiratory physiology of vertebrates. While a lot is known about the physiological transitions required for air‐breathing evolution, there is limited information available on the evolutionary dynamics in breathing mode. Previous analyses suggest 34–67 independently origins of air‐breathing within extant vertebrates, but nothing is known about when in geological time air‐breathing originated or if air‐breathing has been secondarily lost. This study aimed to 1) provide more robust estimates on the number of air‐breathing origins, 2) identify if air‐breathing has been secondarily lost within clades of air‐breathing fishes, and 3) identify the timing of these events. To do this, we used an updated list of air‐breathing fishes, a fully resolved, time‐calibrated fish phylogeny and Bayesian phylogenetic comparative methods. We show that air‐breathing evolved 74–80 times within extant vertebrates, which is significantly higher the previously proposed 34–67 independent origins. Further, we show strong support for 7 secondary losses of air‐breathing, where pure water‐breathing was adapted from an air‐breathing ancestor. Finally, we show that the majority of air‐breathing clades radiated within the last 65 million years. This study adds novel dimensions to the evolution of air‐breathing and identifies an unprecedented evolutionary plasticity in breathing mode, where air‐breathing has been gained and lost repeatedly during the evolutionary history of vertebrates. Support or Funding Information Christian Damsgaard is supported by the Carlsberg Foundation. This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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